Protein–RNA interactions for Protein: P62080

Tspan5, Tetraspanin-5, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan5P62080 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tspan5P62080 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tspan5P62080 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tspan5P62080 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tspan5P62080 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tspan5P62080 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tspan5P62080 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tspan5P62080 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tspan5P62080 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tspan5P62080 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tspan5P62080 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tspan5P62080 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tspan5P62080 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tspan5P62080 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tspan5P62080 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tspan5P62080 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tspan5P62080 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tspan5P62080 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tspan5P62080 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tspan5P62080 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tspan5P62080 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tspan5P62080 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tspan5P62080 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tspan5P62080 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tspan5P62080 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tspan5P62080 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tspan5P62080 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tspan5P62080 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tspan5P62080 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tspan5P62080 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tspan5P62080 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tspan5P62080 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tspan5P62080 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tspan5P62080 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tspan5P62080 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tspan5P62080 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tspan5P62080 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tspan5P62080 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tspan5P62080 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tspan5P62080 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tspan5P62080 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tspan5P62080 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tspan5P62080 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tspan5P62080 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tspan5P62080 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tspan5P62080 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tspan5P62080 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tspan5P62080 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tspan5P62080 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tspan5P62080 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tspan5P62080 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tspan5P62080 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tspan5P62080 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tspan5P62080 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tspan5P62080 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tspan5P62080 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tspan5P62080 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tspan5P62080 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tspan5P62080 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tspan5P62080 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tspan5P62080 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tspan5P62080 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tspan5P62080 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tspan5P62080 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tspan5P62080 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tspan5P62080 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tspan5P62080 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tspan5P62080 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tspan5P62080 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tspan5P62080 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tspan5P62080 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tspan5P62080 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tspan5P62080 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tspan5P62080 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tspan5P62080 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tspan5P62080 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tspan5P62080 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tspan5P62080 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tspan5P62080 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tspan5P62080 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tspan5P62080 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tspan5P62080 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tspan5P62080 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tspan5P62080 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tspan5P62080 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tspan5P62080 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tspan5P62080 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Tspan5P62080 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tspan5P62080 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tspan5P62080 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tspan5P62080 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tspan5P62080 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tspan5P62080 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tspan5P62080 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tspan5P62080 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tspan5P62080 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tspan5P62080 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tspan5P62080 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tspan5P62080 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tspan5P62080 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms