Protein–RNA interactions for Protein: P62069

Usp46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp46P62069 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp46P62069 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp46P62069 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp46P62069 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp46P62069 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp46P62069 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp46P62069 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp46P62069 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp46P62069 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp46P62069 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp46P62069 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp46P62069 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp46P62069 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp46P62069 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp46P62069 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp46P62069 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp46P62069 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp46P62069 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp46P62069 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp46P62069 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp46P62069 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp46P62069 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp46P62069 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp46P62069 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp46P62069 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp46P62069 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp46P62069 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp46P62069 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp46P62069 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp46P62069 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp46P62069 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp46P62069 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp46P62069 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp46P62069 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp46P62069 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp46P62069 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp46P62069 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp46P62069 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp46P62069 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp46P62069 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp46P62069 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp46P62069 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp46P62069 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp46P62069 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp46P62069 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp46P62069 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp46P62069 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp46P62069 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp46P62069 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp46P62069 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp46P62069 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp46P62069 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp46P62069 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp46P62069 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp46P62069 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp46P62069 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp46P62069 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp46P62069 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp46P62069 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp46P62069 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp46P62069 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp46P62069 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp46P62069 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp46P62069 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp46P62069 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp46P62069 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp46P62069 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp46P62069 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp46P62069 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp46P62069 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp46P62069 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp46P62069 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp46P62069 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp46P62069 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp46P62069 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp46P62069 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp46P62069 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp46P62069 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp46P62069 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp46P62069 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp46P62069 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp46P62069 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp46P62069 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp46P62069 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp46P62069 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp46P62069 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp46P62069 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp46P62069 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp46P62069 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp46P62069 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp46P62069 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp46P62069 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp46P62069 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp46P62069 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp46P62069 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp46P62069 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp46P62069 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp46P62069 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp46P62069 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp46P62069 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms