Protein–RNA interactions for Protein: P61969

Lmo4, LIM domain transcription factor LMO4, mousemouse

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Length 165 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo4P61969 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lmo4P61969 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lmo4P61969 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lmo4P61969 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lmo4P61969 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lmo4P61969 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lmo4P61969 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Lmo4P61969 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lmo4P61969 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lmo4P61969 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lmo4P61969 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lmo4P61969 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lmo4P61969 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lmo4P61969 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lmo4P61969 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Lmo4P61969 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Lmo4P61969 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lmo4P61969 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lmo4P61969 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lmo4P61969 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lmo4P61969 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lmo4P61969 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lmo4P61969 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Lmo4P61969 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lmo4P61969 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lmo4P61969 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lmo4P61969 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lmo4P61969 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lmo4P61969 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lmo4P61969 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Lmo4P61969 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lmo4P61969 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lmo4P61969 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lmo4P61969 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lmo4P61969 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lmo4P61969 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lmo4P61969 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lmo4P61969 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lmo4P61969 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lmo4P61969 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lmo4P61969 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lmo4P61969 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lmo4P61969 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lmo4P61969 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lmo4P61969 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lmo4P61969 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lmo4P61969 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lmo4P61969 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lmo4P61969 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lmo4P61969 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lmo4P61969 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lmo4P61969 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Lmo4P61969 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Lmo4P61969 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lmo4P61969 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Lmo4P61969 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lmo4P61969 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lmo4P61969 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lmo4P61969 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lmo4P61969 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lmo4P61969 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lmo4P61969 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lmo4P61969 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lmo4P61969 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Lmo4P61969 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lmo4P61969 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lmo4P61969 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lmo4P61969 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lmo4P61969 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lmo4P61969 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lmo4P61969 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lmo4P61969 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lmo4P61969 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lmo4P61969 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lmo4P61969 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lmo4P61969 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Lmo4P61969 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Lmo4P61969 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lmo4P61969 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lmo4P61969 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lmo4P61969 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lmo4P61969 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lmo4P61969 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lmo4P61969 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lmo4P61969 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lmo4P61969 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lmo4P61969 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lmo4P61969 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Lmo4P61969 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lmo4P61969 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lmo4P61969 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lmo4P61969 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lmo4P61969 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lmo4P61969 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lmo4P61969 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lmo4P61969 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lmo4P61969 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lmo4P61969 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lmo4P61969 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Lmo4P61969 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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