Protein–RNA interactions for Protein: P61809

Cdk5r1, Cyclin-dependent kinase 5 activator 1, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5r1P61809 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdk5r1P61809 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdk5r1P61809 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdk5r1P61809 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdk5r1P61809 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdk5r1P61809 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdk5r1P61809 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdk5r1P61809 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdk5r1P61809 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdk5r1P61809 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdk5r1P61809 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdk5r1P61809 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdk5r1P61809 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdk5r1P61809 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdk5r1P61809 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdk5r1P61809 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdk5r1P61809 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdk5r1P61809 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdk5r1P61809 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdk5r1P61809 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdk5r1P61809 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdk5r1P61809 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdk5r1P61809 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdk5r1P61809 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdk5r1P61809 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdk5r1P61809 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdk5r1P61809 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdk5r1P61809 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdk5r1P61809 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdk5r1P61809 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdk5r1P61809 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdk5r1P61809 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdk5r1P61809 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdk5r1P61809 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdk5r1P61809 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdk5r1P61809 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdk5r1P61809 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdk5r1P61809 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdk5r1P61809 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdk5r1P61809 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdk5r1P61809 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdk5r1P61809 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdk5r1P61809 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdk5r1P61809 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdk5r1P61809 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdk5r1P61809 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdk5r1P61809 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdk5r1P61809 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdk5r1P61809 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdk5r1P61809 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdk5r1P61809 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdk5r1P61809 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdk5r1P61809 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdk5r1P61809 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdk5r1P61809 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdk5r1P61809 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdk5r1P61809 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdk5r1P61809 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdk5r1P61809 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdk5r1P61809 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdk5r1P61809 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdk5r1P61809 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdk5r1P61809 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdk5r1P61809 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdk5r1P61809 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdk5r1P61809 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdk5r1P61809 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdk5r1P61809 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdk5r1P61809 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdk5r1P61809 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdk5r1P61809 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdk5r1P61809 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdk5r1P61809 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdk5r1P61809 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdk5r1P61809 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdk5r1P61809 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdk5r1P61809 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdk5r1P61809 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdk5r1P61809 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdk5r1P61809 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdk5r1P61809 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdk5r1P61809 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdk5r1P61809 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cdk5r1P61809 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cdk5r1P61809 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cdk5r1P61809 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cdk5r1P61809 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cdk5r1P61809 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cdk5r1P61809 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cdk5r1P61809 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdk5r1P61809 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdk5r1P61809 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdk5r1P61809 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdk5r1P61809 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdk5r1P61809 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdk5r1P61809 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdk5r1P61809 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdk5r1P61809 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdk5r1P61809 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdk5r1P61809 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms