Protein–RNA interactions for Protein: P61759

Vbp1, Prefoldin subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vbp1P61759 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vbp1P61759 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vbp1P61759 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vbp1P61759 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vbp1P61759 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vbp1P61759 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vbp1P61759 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vbp1P61759 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vbp1P61759 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vbp1P61759 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vbp1P61759 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vbp1P61759 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vbp1P61759 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vbp1P61759 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vbp1P61759 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vbp1P61759 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vbp1P61759 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vbp1P61759 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vbp1P61759 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vbp1P61759 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vbp1P61759 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vbp1P61759 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vbp1P61759 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vbp1P61759 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vbp1P61759 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vbp1P61759 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vbp1P61759 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vbp1P61759 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vbp1P61759 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vbp1P61759 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vbp1P61759 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vbp1P61759 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vbp1P61759 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vbp1P61759 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vbp1P61759 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vbp1P61759 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vbp1P61759 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vbp1P61759 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vbp1P61759 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vbp1P61759 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vbp1P61759 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vbp1P61759 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vbp1P61759 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vbp1P61759 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vbp1P61759 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vbp1P61759 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vbp1P61759 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Vbp1P61759 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vbp1P61759 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vbp1P61759 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vbp1P61759 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vbp1P61759 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vbp1P61759 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vbp1P61759 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vbp1P61759 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vbp1P61759 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vbp1P61759 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vbp1P61759 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vbp1P61759 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vbp1P61759 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vbp1P61759 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vbp1P61759 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vbp1P61759 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vbp1P61759 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vbp1P61759 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vbp1P61759 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vbp1P61759 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vbp1P61759 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vbp1P61759 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vbp1P61759 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vbp1P61759 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vbp1P61759 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vbp1P61759 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vbp1P61759 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vbp1P61759 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vbp1P61759 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vbp1P61759 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vbp1P61759 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vbp1P61759 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vbp1P61759 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vbp1P61759 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vbp1P61759 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vbp1P61759 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vbp1P61759 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vbp1P61759 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vbp1P61759 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vbp1P61759 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vbp1P61759 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vbp1P61759 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vbp1P61759 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vbp1P61759 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vbp1P61759 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vbp1P61759 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vbp1P61759 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Vbp1P61759 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vbp1P61759 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vbp1P61759 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vbp1P61759 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Vbp1P61759 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vbp1P61759 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms