Protein–RNA interactions for Protein: P61290

Psme3, Proteasome activator complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme3P61290 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Psme3P61290 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Psme3P61290 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Psme3P61290 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Psme3P61290 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Psme3P61290 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Psme3P61290 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Psme3P61290 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Psme3P61290 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Psme3P61290 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Psme3P61290 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Psme3P61290 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Psme3P61290 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Psme3P61290 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Psme3P61290 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Psme3P61290 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Psme3P61290 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Psme3P61290 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Psme3P61290 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Psme3P61290 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Psme3P61290 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Psme3P61290 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Psme3P61290 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Psme3P61290 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Psme3P61290 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Psme3P61290 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Psme3P61290 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Psme3P61290 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Psme3P61290 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Psme3P61290 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Psme3P61290 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Psme3P61290 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Psme3P61290 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Psme3P61290 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Psme3P61290 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Psme3P61290 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Psme3P61290 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Psme3P61290 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Psme3P61290 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Psme3P61290 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Psme3P61290 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Psme3P61290 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Psme3P61290 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Psme3P61290 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Psme3P61290 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Psme3P61290 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Psme3P61290 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Psme3P61290 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Psme3P61290 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Psme3P61290 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Psme3P61290 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Psme3P61290 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Psme3P61290 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Psme3P61290 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Psme3P61290 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Psme3P61290 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Psme3P61290 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Psme3P61290 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Psme3P61290 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Psme3P61290 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Psme3P61290 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Psme3P61290 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Psme3P61290 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Psme3P61290 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Psme3P61290 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Psme3P61290 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Psme3P61290 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Psme3P61290 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Psme3P61290 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Psme3P61290 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Psme3P61290 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Psme3P61290 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Psme3P61290 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Psme3P61290 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Psme3P61290 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Psme3P61290 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Psme3P61290 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Psme3P61290 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Psme3P61290 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Psme3P61290 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Psme3P61290 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Psme3P61290 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Psme3P61290 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Psme3P61290 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Psme3P61290 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Psme3P61290 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Psme3P61290 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Psme3P61290 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Psme3P61290 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Psme3P61290 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Psme3P61290 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Psme3P61290 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Psme3P61290 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Psme3P61290 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Psme3P61290 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Psme3P61290 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Psme3P61290 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Psme3P61290 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Psme3P61290 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Psme3P61290 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms