Protein–RNA interactions for Protein: P60879

Snap25, Synaptosomal-associated protein 25, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap25P60879 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Snap25P60879 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Snap25P60879 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Snap25P60879 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Snap25P60879 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Snap25P60879 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Snap25P60879 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Snap25P60879 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Snap25P60879 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Snap25P60879 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Snap25P60879 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Snap25P60879 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Snap25P60879 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Snap25P60879 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Snap25P60879 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Snap25P60879 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Snap25P60879 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Snap25P60879 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Snap25P60879 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Snap25P60879 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Snap25P60879 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Snap25P60879 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Snap25P60879 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Snap25P60879 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Snap25P60879 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Snap25P60879 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Snap25P60879 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Snap25P60879 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Snap25P60879 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Snap25P60879 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Snap25P60879 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Snap25P60879 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Snap25P60879 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Snap25P60879 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Snap25P60879 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Snap25P60879 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Snap25P60879 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Snap25P60879 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Snap25P60879 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Snap25P60879 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Snap25P60879 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Snap25P60879 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Snap25P60879 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Snap25P60879 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Snap25P60879 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Snap25P60879 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Snap25P60879 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Snap25P60879 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Snap25P60879 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Snap25P60879 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Snap25P60879 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Snap25P60879 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Snap25P60879 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Snap25P60879 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Snap25P60879 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Snap25P60879 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Snap25P60879 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Snap25P60879 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Snap25P60879 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Snap25P60879 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Snap25P60879 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Snap25P60879 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Snap25P60879 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Snap25P60879 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Snap25P60879 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Snap25P60879 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Snap25P60879 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Snap25P60879 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Snap25P60879 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Snap25P60879 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Snap25P60879 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Snap25P60879 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Snap25P60879 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Snap25P60879 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Snap25P60879 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Snap25P60879 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Snap25P60879 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Snap25P60879 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Snap25P60879 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Snap25P60879 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Snap25P60879 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Snap25P60879 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Snap25P60879 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Snap25P60879 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Snap25P60879 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Snap25P60879 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Snap25P60879 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Snap25P60879 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Snap25P60879 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Snap25P60879 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Snap25P60879 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Snap25P60879 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Snap25P60879 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Snap25P60879 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Snap25P60879 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Snap25P60879 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Snap25P60879 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Snap25P60879 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Snap25P60879 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Snap25P60879 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms