Protein–RNA interactions for Protein: P59242

Cgn, Cingulin, mousemouse

Predictions only

Length 1,191 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CgnP59242 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CgnP59242 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CgnP59242 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CgnP59242 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CgnP59242 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CgnP59242 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CgnP59242 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CgnP59242 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CgnP59242 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CgnP59242 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CgnP59242 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CgnP59242 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CgnP59242 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CgnP59242 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CgnP59242 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CgnP59242 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CgnP59242 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CgnP59242 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CgnP59242 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CgnP59242 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CgnP59242 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CgnP59242 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CgnP59242 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CgnP59242 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CgnP59242 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CgnP59242 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CgnP59242 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CgnP59242 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CgnP59242 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CgnP59242 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CgnP59242 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CgnP59242 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CgnP59242 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CgnP59242 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CgnP59242 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CgnP59242 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CgnP59242 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CgnP59242 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CgnP59242 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CgnP59242 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CgnP59242 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CgnP59242 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CgnP59242 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CgnP59242 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CgnP59242 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CgnP59242 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CgnP59242 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CgnP59242 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CgnP59242 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CgnP59242 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CgnP59242 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CgnP59242 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CgnP59242 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CgnP59242 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CgnP59242 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CgnP59242 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CgnP59242 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CgnP59242 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CgnP59242 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CgnP59242 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CgnP59242 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CgnP59242 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CgnP59242 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CgnP59242 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CgnP59242 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CgnP59242 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CgnP59242 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CgnP59242 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CgnP59242 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CgnP59242 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CgnP59242 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CgnP59242 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CgnP59242 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CgnP59242 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CgnP59242 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CgnP59242 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CgnP59242 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CgnP59242 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CgnP59242 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CgnP59242 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CgnP59242 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CgnP59242 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CgnP59242 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CgnP59242 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CgnP59242 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CgnP59242 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CgnP59242 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CgnP59242 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CgnP59242 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CgnP59242 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CgnP59242 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CgnP59242 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CgnP59242 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CgnP59242 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CgnP59242 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CgnP59242 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC21.33■■□□□ 1
CgnP59242 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CgnP59242 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CgnP59242 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CgnP59242 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
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