Protein–RNA interactions for Protein: P59114

Pcif1, Phosphorylated CTD-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcif1P59114 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Pcif1P59114 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pcif1P59114 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pcif1P59114 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pcif1P59114 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pcif1P59114 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pcif1P59114 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pcif1P59114 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pcif1P59114 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pcif1P59114 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pcif1P59114 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Pcif1P59114 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pcif1P59114 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pcif1P59114 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pcif1P59114 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pcif1P59114 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pcif1P59114 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pcif1P59114 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pcif1P59114 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pcif1P59114 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Pcif1P59114 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Pcif1P59114 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pcif1P59114 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pcif1P59114 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pcif1P59114 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pcif1P59114 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pcif1P59114 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pcif1P59114 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pcif1P59114 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pcif1P59114 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pcif1P59114 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pcif1P59114 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Pcif1P59114 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pcif1P59114 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pcif1P59114 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Pcif1P59114 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pcif1P59114 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pcif1P59114 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pcif1P59114 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Pcif1P59114 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Pcif1P59114 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Pcif1P59114 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pcif1P59114 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pcif1P59114 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pcif1P59114 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pcif1P59114 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pcif1P59114 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Pcif1P59114 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pcif1P59114 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pcif1P59114 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pcif1P59114 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pcif1P59114 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pcif1P59114 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pcif1P59114 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pcif1P59114 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pcif1P59114 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pcif1P59114 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pcif1P59114 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pcif1P59114 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pcif1P59114 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pcif1P59114 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pcif1P59114 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pcif1P59114 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pcif1P59114 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pcif1P59114 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pcif1P59114 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pcif1P59114 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pcif1P59114 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pcif1P59114 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pcif1P59114 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pcif1P59114 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pcif1P59114 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pcif1P59114 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pcif1P59114 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pcif1P59114 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Pcif1P59114 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pcif1P59114 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pcif1P59114 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pcif1P59114 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Pcif1P59114 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Pcif1P59114 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pcif1P59114 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pcif1P59114 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pcif1P59114 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pcif1P59114 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pcif1P59114 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pcif1P59114 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pcif1P59114 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pcif1P59114 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pcif1P59114 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pcif1P59114 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pcif1P59114 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pcif1P59114 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pcif1P59114 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Pcif1P59114 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pcif1P59114 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pcif1P59114 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pcif1P59114 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pcif1P59114 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pcif1P59114 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms