Protein–RNA interactions for Protein: P58686

UPF0184 protein C9orf16 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P58686 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P58686 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P58686 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P58686 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P58686 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P58686 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P58686 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P58686 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P58686 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P58686 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P58686 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
P58686 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P58686 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P58686 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P58686 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P58686 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P58686 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P58686 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P58686 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P58686 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P58686 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P58686 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P58686 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P58686 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P58686 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P58686 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P58686 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P58686 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P58686 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P58686 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P58686 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P58686 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P58686 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P58686 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P58686 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P58686 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P58686 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P58686 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P58686 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P58686 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P58686 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P58686 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P58686 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P58686 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P58686 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
P58686 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P58686 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P58686 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P58686 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P58686 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
P58686 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P58686 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P58686 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P58686 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P58686 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P58686 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P58686 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P58686 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P58686 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P58686 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P58686 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P58686 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P58686 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P58686 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P58686 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P58686 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P58686 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P58686 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P58686 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P58686 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P58686 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P58686 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P58686 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P58686 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P58686 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P58686 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P58686 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P58686 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
P58686 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
P58686 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P58686 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P58686 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P58686 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P58686 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P58686 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
P58686 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P58686 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P58686 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P58686 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P58686 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P58686 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P58686 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P58686 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P58686 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P58686 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
P58686 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P58686 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P58686 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P58686 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P58686 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms