Protein–RNA interactions for Protein: P58334

Klf16, Krueppel-like factor 16, mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf16P58334 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Klf16P58334 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Klf16P58334 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Klf16P58334 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Klf16P58334 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Klf16P58334 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Klf16P58334 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Klf16P58334 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Klf16P58334 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Klf16P58334 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Klf16P58334 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Klf16P58334 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Klf16P58334 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Klf16P58334 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Klf16P58334 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Klf16P58334 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Klf16P58334 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Klf16P58334 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Klf16P58334 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Klf16P58334 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Klf16P58334 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Klf16P58334 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Klf16P58334 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Klf16P58334 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Klf16P58334 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Klf16P58334 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Klf16P58334 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Klf16P58334 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Klf16P58334 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Klf16P58334 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Klf16P58334 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Klf16P58334 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Klf16P58334 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Klf16P58334 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Klf16P58334 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Klf16P58334 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Klf16P58334 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Klf16P58334 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Klf16P58334 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klf16P58334 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klf16P58334 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klf16P58334 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klf16P58334 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klf16P58334 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klf16P58334 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Klf16P58334 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klf16P58334 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Klf16P58334 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klf16P58334 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klf16P58334 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klf16P58334 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klf16P58334 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klf16P58334 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klf16P58334 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klf16P58334 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klf16P58334 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klf16P58334 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klf16P58334 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klf16P58334 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Klf16P58334 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Klf16P58334 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Klf16P58334 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Klf16P58334 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Klf16P58334 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Klf16P58334 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Klf16P58334 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Klf16P58334 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Klf16P58334 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Klf16P58334 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Klf16P58334 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Klf16P58334 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Klf16P58334 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Klf16P58334 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Klf16P58334 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Klf16P58334 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Klf16P58334 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Klf16P58334 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Klf16P58334 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Klf16P58334 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Klf16P58334 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Klf16P58334 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Klf16P58334 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Klf16P58334 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Klf16P58334 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Klf16P58334 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Klf16P58334 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Klf16P58334 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Klf16P58334 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Klf16P58334 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Klf16P58334 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Klf16P58334 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Klf16P58334 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Klf16P58334 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Klf16P58334 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Klf16P58334 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Klf16P58334 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Klf16P58334 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Klf16P58334 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Klf16P58334 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Klf16P58334 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms