Protein–RNA interactions for Protein: P57716

Ncstn, Nicastrin, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcstnP57716 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NcstnP57716 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NcstnP57716 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NcstnP57716 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NcstnP57716 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NcstnP57716 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NcstnP57716 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NcstnP57716 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NcstnP57716 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NcstnP57716 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NcstnP57716 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NcstnP57716 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NcstnP57716 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NcstnP57716 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NcstnP57716 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NcstnP57716 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NcstnP57716 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NcstnP57716 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NcstnP57716 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NcstnP57716 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NcstnP57716 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NcstnP57716 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NcstnP57716 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NcstnP57716 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NcstnP57716 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NcstnP57716 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NcstnP57716 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NcstnP57716 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NcstnP57716 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NcstnP57716 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NcstnP57716 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NcstnP57716 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NcstnP57716 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
NcstnP57716 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NcstnP57716 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NcstnP57716 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NcstnP57716 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NcstnP57716 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NcstnP57716 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NcstnP57716 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NcstnP57716 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NcstnP57716 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NcstnP57716 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NcstnP57716 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NcstnP57716 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NcstnP57716 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NcstnP57716 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NcstnP57716 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NcstnP57716 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NcstnP57716 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NcstnP57716 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
NcstnP57716 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NcstnP57716 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NcstnP57716 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NcstnP57716 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NcstnP57716 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NcstnP57716 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NcstnP57716 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NcstnP57716 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NcstnP57716 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NcstnP57716 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NcstnP57716 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NcstnP57716 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NcstnP57716 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NcstnP57716 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NcstnP57716 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NcstnP57716 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NcstnP57716 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NcstnP57716 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
NcstnP57716 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NcstnP57716 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NcstnP57716 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NcstnP57716 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NcstnP57716 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NcstnP57716 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NcstnP57716 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NcstnP57716 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NcstnP57716 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NcstnP57716 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NcstnP57716 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NcstnP57716 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
NcstnP57716 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
NcstnP57716 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NcstnP57716 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NcstnP57716 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NcstnP57716 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NcstnP57716 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NcstnP57716 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NcstnP57716 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NcstnP57716 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NcstnP57716 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NcstnP57716 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
NcstnP57716 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NcstnP57716 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NcstnP57716 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NcstnP57716 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NcstnP57716 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
NcstnP57716 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NcstnP57716 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NcstnP57716 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms