Protein–RNA interactions for Protein: P56916

Gsc2, Homeobox protein goosecoid-2, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsc2P56916 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gsc2P56916 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gsc2P56916 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gsc2P56916 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gsc2P56916 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gsc2P56916 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gsc2P56916 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gsc2P56916 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gsc2P56916 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gsc2P56916 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gsc2P56916 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gsc2P56916 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gsc2P56916 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gsc2P56916 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gsc2P56916 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gsc2P56916 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gsc2P56916 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gsc2P56916 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gsc2P56916 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gsc2P56916 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gsc2P56916 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gsc2P56916 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gsc2P56916 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gsc2P56916 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gsc2P56916 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gsc2P56916 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gsc2P56916 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gsc2P56916 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gsc2P56916 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gsc2P56916 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gsc2P56916 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gsc2P56916 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gsc2P56916 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gsc2P56916 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gsc2P56916 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gsc2P56916 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gsc2P56916 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gsc2P56916 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gsc2P56916 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gsc2P56916 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gsc2P56916 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gsc2P56916 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gsc2P56916 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gsc2P56916 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gsc2P56916 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gsc2P56916 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gsc2P56916 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gsc2P56916 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gsc2P56916 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gsc2P56916 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gsc2P56916 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gsc2P56916 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gsc2P56916 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gsc2P56916 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gsc2P56916 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gsc2P56916 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gsc2P56916 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gsc2P56916 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gsc2P56916 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gsc2P56916 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gsc2P56916 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gsc2P56916 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gsc2P56916 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gsc2P56916 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gsc2P56916 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gsc2P56916 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gsc2P56916 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gsc2P56916 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gsc2P56916 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gsc2P56916 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gsc2P56916 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gsc2P56916 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gsc2P56916 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gsc2P56916 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gsc2P56916 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Gsc2P56916 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gsc2P56916 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gsc2P56916 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gsc2P56916 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gsc2P56916 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gsc2P56916 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gsc2P56916 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gsc2P56916 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gsc2P56916 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gsc2P56916 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gsc2P56916 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gsc2P56916 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gsc2P56916 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gsc2P56916 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gsc2P56916 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gsc2P56916 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gsc2P56916 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gsc2P56916 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gsc2P56916 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gsc2P56916 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gsc2P56916 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gsc2P56916 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gsc2P56916 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gsc2P56916 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gsc2P56916 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms