Protein–RNA interactions for Protein: P56400

Gp1bb, Platelet glycoprotein Ib beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1bbP56400 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gp1bbP56400 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gp1bbP56400 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gp1bbP56400 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gp1bbP56400 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gp1bbP56400 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gp1bbP56400 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gp1bbP56400 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gp1bbP56400 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gp1bbP56400 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gp1bbP56400 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gp1bbP56400 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gp1bbP56400 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gp1bbP56400 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gp1bbP56400 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gp1bbP56400 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gp1bbP56400 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gp1bbP56400 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gp1bbP56400 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gp1bbP56400 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gp1bbP56400 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gp1bbP56400 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gp1bbP56400 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Gp1bbP56400 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gp1bbP56400 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Gp1bbP56400 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gp1bbP56400 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Gp1bbP56400 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Gp1bbP56400 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gp1bbP56400 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gp1bbP56400 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gp1bbP56400 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gp1bbP56400 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gp1bbP56400 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gp1bbP56400 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gp1bbP56400 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gp1bbP56400 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gp1bbP56400 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gp1bbP56400 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gp1bbP56400 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gp1bbP56400 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gp1bbP56400 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gp1bbP56400 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gp1bbP56400 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gp1bbP56400 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gp1bbP56400 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gp1bbP56400 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gp1bbP56400 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gp1bbP56400 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gp1bbP56400 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gp1bbP56400 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gp1bbP56400 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gp1bbP56400 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gp1bbP56400 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gp1bbP56400 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gp1bbP56400 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gp1bbP56400 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gp1bbP56400 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Gp1bbP56400 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gp1bbP56400 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gp1bbP56400 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gp1bbP56400 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gp1bbP56400 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gp1bbP56400 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gp1bbP56400 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gp1bbP56400 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gp1bbP56400 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gp1bbP56400 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gp1bbP56400 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gp1bbP56400 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gp1bbP56400 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gp1bbP56400 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gp1bbP56400 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gp1bbP56400 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gp1bbP56400 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gp1bbP56400 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Gp1bbP56400 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Gp1bbP56400 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Gp1bbP56400 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gp1bbP56400 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gp1bbP56400 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gp1bbP56400 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gp1bbP56400 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gp1bbP56400 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gp1bbP56400 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Gp1bbP56400 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Gp1bbP56400 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Gp1bbP56400 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Gp1bbP56400 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Gp1bbP56400 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Gp1bbP56400 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Gp1bbP56400 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gp1bbP56400 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gp1bbP56400 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gp1bbP56400 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gp1bbP56400 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Gp1bbP56400 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gp1bbP56400 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gp1bbP56400 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gp1bbP56400 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms