Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sh3bp1P55194 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sh3bp1P55194 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sh3bp1P55194 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sh3bp1P55194 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sh3bp1P55194 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sh3bp1P55194 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sh3bp1P55194 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sh3bp1P55194 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sh3bp1P55194 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sh3bp1P55194 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sh3bp1P55194 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sh3bp1P55194 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sh3bp1P55194 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sh3bp1P55194 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sh3bp1P55194 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sh3bp1P55194 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sh3bp1P55194 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sh3bp1P55194 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sh3bp1P55194 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sh3bp1P55194 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sh3bp1P55194 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sh3bp1P55194 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sh3bp1P55194 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sh3bp1P55194 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sh3bp1P55194 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sh3bp1P55194 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sh3bp1P55194 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sh3bp1P55194 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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Sh3bp1P55194 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sh3bp1P55194 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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Sh3bp1P55194 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sh3bp1P55194 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
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Sh3bp1P55194 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sh3bp1P55194 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sh3bp1P55194 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sh3bp1P55194 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sh3bp1P55194 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sh3bp1P55194 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sh3bp1P55194 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
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Sh3bp1P55194 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
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Sh3bp1P55194 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
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Sh3bp1P55194 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sh3bp1P55194 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sh3bp1P55194 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sh3bp1P55194 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sh3bp1P55194 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sh3bp1P55194 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
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Sh3bp1P55194 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sh3bp1P55194 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sh3bp1P55194 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sh3bp1P55194 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sh3bp1P55194 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sh3bp1P55194 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sh3bp1P55194 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Sh3bp1P55194 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sh3bp1P55194 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sh3bp1P55194 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sh3bp1P55194 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sh3bp1P55194 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sh3bp1P55194 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Sh3bp1P55194 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sh3bp1P55194 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Sh3bp1P55194 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Sh3bp1P55194 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sh3bp1P55194 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sh3bp1P55194 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
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Sh3bp1P55194 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sh3bp1P55194 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
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