Protein–RNA interactions for Protein: P54987

Acod1, Cis-aconitate decarboxylase, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acod1P54987 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Acod1P54987 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Acod1P54987 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Acod1P54987 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Acod1P54987 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Acod1P54987 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Acod1P54987 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Acod1P54987 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Acod1P54987 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Acod1P54987 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Acod1P54987 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Acod1P54987 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Acod1P54987 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Acod1P54987 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Acod1P54987 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Acod1P54987 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Acod1P54987 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Acod1P54987 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Acod1P54987 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Acod1P54987 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Acod1P54987 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Acod1P54987 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Acod1P54987 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Acod1P54987 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Acod1P54987 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Acod1P54987 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Acod1P54987 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Acod1P54987 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Acod1P54987 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Acod1P54987 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Acod1P54987 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Acod1P54987 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Acod1P54987 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Acod1P54987 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Acod1P54987 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Acod1P54987 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Acod1P54987 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Acod1P54987 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Acod1P54987 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Acod1P54987 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Acod1P54987 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Acod1P54987 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Acod1P54987 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Acod1P54987 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Acod1P54987 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Acod1P54987 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Acod1P54987 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Acod1P54987 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Acod1P54987 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Acod1P54987 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Acod1P54987 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Acod1P54987 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Acod1P54987 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Acod1P54987 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Acod1P54987 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Acod1P54987 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Acod1P54987 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Acod1P54987 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Acod1P54987 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Acod1P54987 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Acod1P54987 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Acod1P54987 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Acod1P54987 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Acod1P54987 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Acod1P54987 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Acod1P54987 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Acod1P54987 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Acod1P54987 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Acod1P54987 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Acod1P54987 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Acod1P54987 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Acod1P54987 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Acod1P54987 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Acod1P54987 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Acod1P54987 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Acod1P54987 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Acod1P54987 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Acod1P54987 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Acod1P54987 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Acod1P54987 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Acod1P54987 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Acod1P54987 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Acod1P54987 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Acod1P54987 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Acod1P54987 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Acod1P54987 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Acod1P54987 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Acod1P54987 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Acod1P54987 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Acod1P54987 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Acod1P54987 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Acod1P54987 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Acod1P54987 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Acod1P54987 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Acod1P54987 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Acod1P54987 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Acod1P54987 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Acod1P54987 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Acod1P54987 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Acod1P54987 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms