Protein–RNA interactions for Protein: P54099

Polg, DNA polymerase subunit gamma-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolgP54099 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PolgP54099 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PolgP54099 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PolgP54099 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PolgP54099 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PolgP54099 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PolgP54099 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PolgP54099 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PolgP54099 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PolgP54099 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PolgP54099 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PolgP54099 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PolgP54099 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PolgP54099 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PolgP54099 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PolgP54099 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PolgP54099 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PolgP54099 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PolgP54099 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PolgP54099 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PolgP54099 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PolgP54099 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PolgP54099 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PolgP54099 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PolgP54099 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PolgP54099 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PolgP54099 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PolgP54099 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PolgP54099 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PolgP54099 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PolgP54099 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PolgP54099 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PolgP54099 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PolgP54099 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PolgP54099 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PolgP54099 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PolgP54099 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PolgP54099 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PolgP54099 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
PolgP54099 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PolgP54099 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PolgP54099 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PolgP54099 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PolgP54099 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PolgP54099 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PolgP54099 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PolgP54099 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PolgP54099 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PolgP54099 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PolgP54099 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PolgP54099 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PolgP54099 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PolgP54099 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PolgP54099 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PolgP54099 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
PolgP54099 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PolgP54099 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PolgP54099 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PolgP54099 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PolgP54099 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PolgP54099 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PolgP54099 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PolgP54099 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PolgP54099 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PolgP54099 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PolgP54099 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PolgP54099 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PolgP54099 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PolgP54099 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PolgP54099 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PolgP54099 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PolgP54099 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PolgP54099 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PolgP54099 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PolgP54099 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PolgP54099 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PolgP54099 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PolgP54099 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PolgP54099 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PolgP54099 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PolgP54099 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PolgP54099 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PolgP54099 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PolgP54099 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PolgP54099 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PolgP54099 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PolgP54099 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PolgP54099 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PolgP54099 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PolgP54099 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PolgP54099 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PolgP54099 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PolgP54099 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PolgP54099 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PolgP54099 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PolgP54099 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PolgP54099 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PolgP54099 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PolgP54099 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PolgP54099 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms