Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PctpP53808 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PctpP53808 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PctpP53808 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PctpP53808 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PctpP53808 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PctpP53808 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PctpP53808 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PctpP53808 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PctpP53808 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PctpP53808 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PctpP53808 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PctpP53808 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PctpP53808 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PctpP53808 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PctpP53808 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PctpP53808 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PctpP53808 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PctpP53808 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PctpP53808 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PctpP53808 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PctpP53808 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PctpP53808 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PctpP53808 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PctpP53808 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PctpP53808 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PctpP53808 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PctpP53808 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PctpP53808 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PctpP53808 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PctpP53808 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PctpP53808 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PctpP53808 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PctpP53808 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PctpP53808 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PctpP53808 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PctpP53808 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PctpP53808 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PctpP53808 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PctpP53808 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PctpP53808 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PctpP53808 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PctpP53808 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PctpP53808 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PctpP53808 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PctpP53808 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PctpP53808 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PctpP53808 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PctpP53808 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PctpP53808 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PctpP53808 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PctpP53808 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PctpP53808 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PctpP53808 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PctpP53808 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PctpP53808 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PctpP53808 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PctpP53808 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PctpP53808 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PctpP53808 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PctpP53808 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PctpP53808 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PctpP53808 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PctpP53808 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PctpP53808 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PctpP53808 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PctpP53808 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PctpP53808 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PctpP53808 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PctpP53808 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PctpP53808 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PctpP53808 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PctpP53808 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PctpP53808 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PctpP53808 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PctpP53808 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PctpP53808 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PctpP53808 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PctpP53808 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PctpP53808 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PctpP53808 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PctpP53808 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PctpP53808 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PctpP53808 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PctpP53808 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PctpP53808 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PctpP53808 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PctpP53808 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PctpP53808 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PctpP53808 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PctpP53808 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PctpP53808 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PctpP53808 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PctpP53808 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PctpP53808 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PctpP53808 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PctpP53808 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PctpP53808 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PctpP53808 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PctpP53808 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms