Protein–RNA interactions for Protein: P53564

Cux1, Homeobox protein cut-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux1P53564 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cux1P53564 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cux1P53564 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cux1P53564 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cux1P53564 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cux1P53564 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cux1P53564 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cux1P53564 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cux1P53564 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cux1P53564 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cux1P53564 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cux1P53564 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Cux1P53564 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Cux1P53564 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Cux1P53564 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Cux1P53564 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Cux1P53564 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cux1P53564 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cux1P53564 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cux1P53564 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cux1P53564 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cux1P53564 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Cux1P53564 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cux1P53564 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cux1P53564 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cux1P53564 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cux1P53564 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cux1P53564 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cux1P53564 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cux1P53564 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Cux1P53564 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cux1P53564 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cux1P53564 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cux1P53564 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cux1P53564 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Cux1P53564 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Cux1P53564 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cux1P53564 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cux1P53564 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cux1P53564 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cux1P53564 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cux1P53564 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cux1P53564 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cux1P53564 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cux1P53564 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Cux1P53564 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cux1P53564 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Cux1P53564 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cux1P53564 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cux1P53564 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cux1P53564 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cux1P53564 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cux1P53564 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cux1P53564 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cux1P53564 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cux1P53564 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cux1P53564 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cux1P53564 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Cux1P53564 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Cux1P53564 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Cux1P53564 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cux1P53564 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Cux1P53564 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cux1P53564 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cux1P53564 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Cux1P53564 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Cux1P53564 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cux1P53564 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cux1P53564 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cux1P53564 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cux1P53564 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cux1P53564 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Cux1P53564 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cux1P53564 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cux1P53564 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cux1P53564 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cux1P53564 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cux1P53564 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cux1P53564 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Cux1P53564 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cux1P53564 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cux1P53564 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cux1P53564 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cux1P53564 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cux1P53564 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Cux1P53564 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cux1P53564 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Cux1P53564 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cux1P53564 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cux1P53564 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cux1P53564 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cux1P53564 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cux1P53564 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cux1P53564 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cux1P53564 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cux1P53564 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cux1P53564 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cux1P53564 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cux1P53564 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cux1P53564 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms