Protein–RNA interactions for Protein: P52795

Efnb1, Ephrin-B1, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efnb1P52795 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Efnb1P52795 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Efnb1P52795 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Efnb1P52795 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Efnb1P52795 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Efnb1P52795 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Efnb1P52795 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Efnb1P52795 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Efnb1P52795 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Efnb1P52795 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Efnb1P52795 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Efnb1P52795 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Efnb1P52795 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Efnb1P52795 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Efnb1P52795 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Efnb1P52795 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Efnb1P52795 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Efnb1P52795 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Efnb1P52795 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Efnb1P52795 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Efnb1P52795 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Efnb1P52795 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Efnb1P52795 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Efnb1P52795 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Efnb1P52795 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Efnb1P52795 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Efnb1P52795 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Efnb1P52795 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Efnb1P52795 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Efnb1P52795 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Efnb1P52795 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Efnb1P52795 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Efnb1P52795 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Efnb1P52795 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Efnb1P52795 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Efnb1P52795 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Efnb1P52795 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Efnb1P52795 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Efnb1P52795 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Efnb1P52795 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Efnb1P52795 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Efnb1P52795 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Efnb1P52795 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Efnb1P52795 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Efnb1P52795 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Efnb1P52795 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Efnb1P52795 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Efnb1P52795 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Efnb1P52795 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Efnb1P52795 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Efnb1P52795 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Efnb1P52795 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Efnb1P52795 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Efnb1P52795 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Efnb1P52795 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Efnb1P52795 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Efnb1P52795 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Efnb1P52795 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Efnb1P52795 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Efnb1P52795 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Efnb1P52795 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Efnb1P52795 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Efnb1P52795 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Efnb1P52795 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Efnb1P52795 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Efnb1P52795 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Efnb1P52795 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Efnb1P52795 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Efnb1P52795 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Efnb1P52795 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Efnb1P52795 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Efnb1P52795 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Efnb1P52795 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Efnb1P52795 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Efnb1P52795 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Efnb1P52795 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Efnb1P52795 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Efnb1P52795 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Efnb1P52795 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Efnb1P52795 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Efnb1P52795 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Efnb1P52795 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Efnb1P52795 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Efnb1P52795 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Efnb1P52795 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Efnb1P52795 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Efnb1P52795 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Efnb1P52795 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Efnb1P52795 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Efnb1P52795 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Efnb1P52795 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Efnb1P52795 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Efnb1P52795 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Efnb1P52795 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Efnb1P52795 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Efnb1P52795 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Efnb1P52795 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Efnb1P52795 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Efnb1P52795 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Efnb1P52795 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms