Protein–RNA interactions for Protein: P52734

Fgd1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd1P52734 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Fgd1P52734 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Fgd1P52734 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Fgd1P52734 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Fgd1P52734 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fgd1P52734 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fgd1P52734 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fgd1P52734 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fgd1P52734 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fgd1P52734 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fgd1P52734 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fgd1P52734 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fgd1P52734 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Fgd1P52734 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fgd1P52734 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fgd1P52734 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fgd1P52734 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fgd1P52734 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fgd1P52734 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fgd1P52734 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fgd1P52734 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fgd1P52734 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fgd1P52734 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fgd1P52734 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fgd1P52734 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fgd1P52734 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fgd1P52734 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fgd1P52734 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fgd1P52734 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fgd1P52734 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fgd1P52734 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fgd1P52734 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fgd1P52734 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fgd1P52734 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fgd1P52734 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Fgd1P52734 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fgd1P52734 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fgd1P52734 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fgd1P52734 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fgd1P52734 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fgd1P52734 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fgd1P52734 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fgd1P52734 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fgd1P52734 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fgd1P52734 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fgd1P52734 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fgd1P52734 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fgd1P52734 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fgd1P52734 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fgd1P52734 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fgd1P52734 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fgd1P52734 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fgd1P52734 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fgd1P52734 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Fgd1P52734 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fgd1P52734 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fgd1P52734 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fgd1P52734 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fgd1P52734 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fgd1P52734 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fgd1P52734 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fgd1P52734 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fgd1P52734 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fgd1P52734 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fgd1P52734 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fgd1P52734 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fgd1P52734 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fgd1P52734 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fgd1P52734 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fgd1P52734 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fgd1P52734 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fgd1P52734 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fgd1P52734 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fgd1P52734 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fgd1P52734 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fgd1P52734 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fgd1P52734 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fgd1P52734 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fgd1P52734 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fgd1P52734 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fgd1P52734 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fgd1P52734 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Fgd1P52734 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fgd1P52734 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fgd1P52734 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fgd1P52734 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fgd1P52734 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fgd1P52734 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fgd1P52734 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fgd1P52734 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fgd1P52734 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fgd1P52734 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Fgd1P52734 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fgd1P52734 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fgd1P52734 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fgd1P52734 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fgd1P52734 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fgd1P52734 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fgd1P52734 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fgd1P52734 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms