Protein–RNA interactions for Protein: P52483

Ube2e3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e3P52483 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ube2e3P52483 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ube2e3P52483 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ube2e3P52483 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ube2e3P52483 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ube2e3P52483 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ube2e3P52483 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ube2e3P52483 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ube2e3P52483 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ube2e3P52483 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ube2e3P52483 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ube2e3P52483 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ube2e3P52483 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ube2e3P52483 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ube2e3P52483 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ube2e3P52483 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ube2e3P52483 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ube2e3P52483 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ube2e3P52483 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ube2e3P52483 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ube2e3P52483 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ube2e3P52483 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ube2e3P52483 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ube2e3P52483 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ube2e3P52483 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Ube2e3P52483 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ube2e3P52483 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ube2e3P52483 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ube2e3P52483 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ube2e3P52483 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ube2e3P52483 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ube2e3P52483 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ube2e3P52483 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ube2e3P52483 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ube2e3P52483 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ube2e3P52483 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ube2e3P52483 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ube2e3P52483 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ube2e3P52483 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ube2e3P52483 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ube2e3P52483 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ube2e3P52483 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ube2e3P52483 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ube2e3P52483 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ube2e3P52483 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ube2e3P52483 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ube2e3P52483 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ube2e3P52483 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ube2e3P52483 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ube2e3P52483 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ube2e3P52483 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ube2e3P52483 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ube2e3P52483 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ube2e3P52483 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ube2e3P52483 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ube2e3P52483 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ube2e3P52483 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ube2e3P52483 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ube2e3P52483 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ube2e3P52483 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ube2e3P52483 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ube2e3P52483 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ube2e3P52483 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ube2e3P52483 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ube2e3P52483 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ube2e3P52483 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ube2e3P52483 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ube2e3P52483 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ube2e3P52483 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ube2e3P52483 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ube2e3P52483 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ube2e3P52483 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ube2e3P52483 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ube2e3P52483 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ube2e3P52483 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ube2e3P52483 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ube2e3P52483 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ube2e3P52483 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ube2e3P52483 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ube2e3P52483 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ube2e3P52483 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ube2e3P52483 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ube2e3P52483 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ube2e3P52483 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ube2e3P52483 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ube2e3P52483 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ube2e3P52483 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ube2e3P52483 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ube2e3P52483 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ube2e3P52483 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ube2e3P52483 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ube2e3P52483 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ube2e3P52483 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ube2e3P52483 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ube2e3P52483 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ube2e3P52483 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ube2e3P52483 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ube2e3P52483 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ube2e3P52483 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ube2e3P52483 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms