Protein–RNA interactions for Protein: P51908

Apobec1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec1P51908 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Apobec1P51908 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apobec1P51908 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apobec1P51908 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apobec1P51908 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apobec1P51908 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apobec1P51908 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apobec1P51908 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apobec1P51908 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apobec1P51908 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apobec1P51908 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apobec1P51908 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apobec1P51908 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Apobec1P51908 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apobec1P51908 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apobec1P51908 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apobec1P51908 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apobec1P51908 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apobec1P51908 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Apobec1P51908 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Apobec1P51908 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Apobec1P51908 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apobec1P51908 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Apobec1P51908 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Apobec1P51908 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Apobec1P51908 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Apobec1P51908 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Apobec1P51908 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Apobec1P51908 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Apobec1P51908 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Apobec1P51908 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Apobec1P51908 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Apobec1P51908 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Apobec1P51908 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Apobec1P51908 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Apobec1P51908 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apobec1P51908 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apobec1P51908 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apobec1P51908 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apobec1P51908 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apobec1P51908 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apobec1P51908 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apobec1P51908 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apobec1P51908 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Apobec1P51908 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apobec1P51908 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apobec1P51908 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apobec1P51908 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apobec1P51908 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apobec1P51908 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apobec1P51908 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Apobec1P51908 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Apobec1P51908 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Apobec1P51908 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Apobec1P51908 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Apobec1P51908 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Apobec1P51908 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Apobec1P51908 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Apobec1P51908 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Apobec1P51908 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Apobec1P51908 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Apobec1P51908 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Apobec1P51908 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Apobec1P51908 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Apobec1P51908 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Apobec1P51908 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Apobec1P51908 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Apobec1P51908 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Apobec1P51908 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Apobec1P51908 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Apobec1P51908 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Apobec1P51908 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Apobec1P51908 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Apobec1P51908 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Apobec1P51908 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Apobec1P51908 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Apobec1P51908 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Apobec1P51908 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Apobec1P51908 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Apobec1P51908 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Apobec1P51908 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apobec1P51908 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apobec1P51908 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apobec1P51908 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apobec1P51908 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apobec1P51908 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apobec1P51908 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apobec1P51908 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apobec1P51908 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apobec1P51908 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apobec1P51908 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apobec1P51908 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Apobec1P51908 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Apobec1P51908 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Apobec1P51908 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Apobec1P51908 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Apobec1P51908 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Apobec1P51908 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Apobec1P51908 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Apobec1P51908 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms