Protein–RNA interactions for Protein: P51655

Gpc4, Glypican-4, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc4P51655 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Gpc4P51655 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gpc4P51655 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gpc4P51655 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gpc4P51655 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gpc4P51655 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gpc4P51655 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gpc4P51655 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gpc4P51655 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gpc4P51655 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Gpc4P51655 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gpc4P51655 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gpc4P51655 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gpc4P51655 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gpc4P51655 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gpc4P51655 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gpc4P51655 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gpc4P51655 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gpc4P51655 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gpc4P51655 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gpc4P51655 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gpc4P51655 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gpc4P51655 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gpc4P51655 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gpc4P51655 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gpc4P51655 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Gpc4P51655 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gpc4P51655 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gpc4P51655 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gpc4P51655 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gpc4P51655 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gpc4P51655 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gpc4P51655 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gpc4P51655 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gpc4P51655 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gpc4P51655 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gpc4P51655 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gpc4P51655 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gpc4P51655 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gpc4P51655 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gpc4P51655 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gpc4P51655 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gpc4P51655 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gpc4P51655 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gpc4P51655 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gpc4P51655 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gpc4P51655 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gpc4P51655 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gpc4P51655 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gpc4P51655 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gpc4P51655 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gpc4P51655 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gpc4P51655 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gpc4P51655 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gpc4P51655 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gpc4P51655 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gpc4P51655 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gpc4P51655 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gpc4P51655 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gpc4P51655 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gpc4P51655 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gpc4P51655 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gpc4P51655 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gpc4P51655 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gpc4P51655 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gpc4P51655 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gpc4P51655 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gpc4P51655 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gpc4P51655 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gpc4P51655 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gpc4P51655 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gpc4P51655 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gpc4P51655 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gpc4P51655 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gpc4P51655 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gpc4P51655 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Gpc4P51655 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gpc4P51655 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Gpc4P51655 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gpc4P51655 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gpc4P51655 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gpc4P51655 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gpc4P51655 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gpc4P51655 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gpc4P51655 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gpc4P51655 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gpc4P51655 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Gpc4P51655 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gpc4P51655 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gpc4P51655 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gpc4P51655 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gpc4P51655 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gpc4P51655 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Gpc4P51655 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Gpc4P51655 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gpc4P51655 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gpc4P51655 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gpc4P51655 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gpc4P51655 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gpc4P51655 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms