Protein–RNA interactions for Protein: P50446

Krt6a, Keratin, type II cytoskeletal 6A, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt6aP50446 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt6aP50446 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt6aP50446 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt6aP50446 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Krt6aP50446 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Krt6aP50446 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Krt6aP50446 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Krt6aP50446 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Krt6aP50446 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt6aP50446 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt6aP50446 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt6aP50446 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt6aP50446 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt6aP50446 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt6aP50446 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt6aP50446 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt6aP50446 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt6aP50446 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt6aP50446 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt6aP50446 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt6aP50446 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt6aP50446 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt6aP50446 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt6aP50446 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt6aP50446 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt6aP50446 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt6aP50446 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt6aP50446 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt6aP50446 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt6aP50446 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt6aP50446 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt6aP50446 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt6aP50446 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt6aP50446 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt6aP50446 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt6aP50446 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt6aP50446 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt6aP50446 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt6aP50446 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt6aP50446 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt6aP50446 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt6aP50446 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt6aP50446 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt6aP50446 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt6aP50446 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt6aP50446 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt6aP50446 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt6aP50446 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt6aP50446 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt6aP50446 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt6aP50446 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt6aP50446 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt6aP50446 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt6aP50446 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt6aP50446 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt6aP50446 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt6aP50446 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt6aP50446 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt6aP50446 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt6aP50446 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt6aP50446 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt6aP50446 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt6aP50446 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt6aP50446 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt6aP50446 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt6aP50446 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt6aP50446 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt6aP50446 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt6aP50446 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt6aP50446 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt6aP50446 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt6aP50446 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt6aP50446 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt6aP50446 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt6aP50446 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt6aP50446 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt6aP50446 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt6aP50446 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt6aP50446 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt6aP50446 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt6aP50446 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt6aP50446 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt6aP50446 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt6aP50446 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt6aP50446 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Krt6aP50446 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Krt6aP50446 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Krt6aP50446 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Krt6aP50446 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Krt6aP50446 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Krt6aP50446 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Krt6aP50446 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt6aP50446 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt6aP50446 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt6aP50446 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt6aP50446 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt6aP50446 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt6aP50446 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt6aP50446 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt6aP50446 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms