Protein–RNA interactions for Protein: P50283

Cd7, T-cell antigen CD7, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd7P50283 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd7P50283 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd7P50283 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd7P50283 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd7P50283 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd7P50283 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd7P50283 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd7P50283 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd7P50283 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd7P50283 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd7P50283 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd7P50283 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd7P50283 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd7P50283 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd7P50283 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd7P50283 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd7P50283 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd7P50283 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd7P50283 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd7P50283 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd7P50283 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd7P50283 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd7P50283 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd7P50283 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd7P50283 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd7P50283 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd7P50283 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd7P50283 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd7P50283 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd7P50283 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd7P50283 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd7P50283 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd7P50283 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd7P50283 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd7P50283 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd7P50283 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd7P50283 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd7P50283 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd7P50283 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd7P50283 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd7P50283 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd7P50283 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd7P50283 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd7P50283 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd7P50283 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd7P50283 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd7P50283 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd7P50283 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd7P50283 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd7P50283 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd7P50283 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd7P50283 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd7P50283 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd7P50283 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd7P50283 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd7P50283 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd7P50283 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd7P50283 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd7P50283 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd7P50283 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd7P50283 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd7P50283 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd7P50283 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd7P50283 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd7P50283 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd7P50283 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd7P50283 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd7P50283 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd7P50283 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd7P50283 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd7P50283 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd7P50283 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd7P50283 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd7P50283 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd7P50283 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd7P50283 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd7P50283 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd7P50283 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd7P50283 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd7P50283 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd7P50283 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd7P50283 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd7P50283 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd7P50283 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd7P50283 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd7P50283 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd7P50283 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd7P50283 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd7P50283 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd7P50283 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd7P50283 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd7P50283 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd7P50283 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd7P50283 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd7P50283 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd7P50283 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd7P50283 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd7P50283 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd7P50283 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd7P50283 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms