Protein–RNA interactions for Protein: P49962

Srp9, Signal recognition particle 9 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp9P49962 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srp9P49962 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srp9P49962 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srp9P49962 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srp9P49962 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srp9P49962 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srp9P49962 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srp9P49962 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srp9P49962 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srp9P49962 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srp9P49962 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srp9P49962 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Srp9P49962 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srp9P49962 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srp9P49962 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Srp9P49962 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srp9P49962 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srp9P49962 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srp9P49962 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srp9P49962 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srp9P49962 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srp9P49962 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srp9P49962 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srp9P49962 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srp9P49962 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Srp9P49962 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Srp9P49962 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Srp9P49962 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srp9P49962 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srp9P49962 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srp9P49962 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srp9P49962 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srp9P49962 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srp9P49962 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srp9P49962 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srp9P49962 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srp9P49962 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srp9P49962 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srp9P49962 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srp9P49962 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srp9P49962 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srp9P49962 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srp9P49962 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srp9P49962 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srp9P49962 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srp9P49962 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Srp9P49962 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srp9P49962 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srp9P49962 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srp9P49962 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srp9P49962 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srp9P49962 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srp9P49962 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srp9P49962 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srp9P49962 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srp9P49962 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srp9P49962 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srp9P49962 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srp9P49962 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srp9P49962 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srp9P49962 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srp9P49962 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srp9P49962 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srp9P49962 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srp9P49962 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srp9P49962 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srp9P49962 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srp9P49962 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srp9P49962 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srp9P49962 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srp9P49962 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srp9P49962 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srp9P49962 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srp9P49962 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srp9P49962 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srp9P49962 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srp9P49962 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srp9P49962 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srp9P49962 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srp9P49962 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srp9P49962 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srp9P49962 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srp9P49962 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srp9P49962 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srp9P49962 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srp9P49962 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srp9P49962 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srp9P49962 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srp9P49962 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Srp9P49962 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srp9P49962 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srp9P49962 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srp9P49962 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srp9P49962 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srp9P49962 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srp9P49962 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srp9P49962 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srp9P49962 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srp9P49962 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srp9P49962 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms