Protein–RNA interactions for Protein: P49817

Cav1, Caveolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cav1P49817 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Cav1P49817 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cav1P49817 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cav1P49817 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cav1P49817 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cav1P49817 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cav1P49817 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cav1P49817 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cav1P49817 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cav1P49817 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cav1P49817 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Cav1P49817 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Cav1P49817 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cav1P49817 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cav1P49817 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cav1P49817 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cav1P49817 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cav1P49817 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cav1P49817 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cav1P49817 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cav1P49817 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cav1P49817 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cav1P49817 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cav1P49817 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cav1P49817 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cav1P49817 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cav1P49817 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cav1P49817 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cav1P49817 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cav1P49817 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cav1P49817 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cav1P49817 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cav1P49817 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cav1P49817 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cav1P49817 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cav1P49817 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Cav1P49817 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cav1P49817 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cav1P49817 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cav1P49817 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cav1P49817 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Cav1P49817 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Cav1P49817 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cav1P49817 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cav1P49817 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cav1P49817 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cav1P49817 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cav1P49817 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cav1P49817 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cav1P49817 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cav1P49817 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cav1P49817 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cav1P49817 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cav1P49817 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cav1P49817 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cav1P49817 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cav1P49817 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cav1P49817 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cav1P49817 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cav1P49817 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cav1P49817 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cav1P49817 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cav1P49817 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cav1P49817 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cav1P49817 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cav1P49817 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cav1P49817 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cav1P49817 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cav1P49817 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cav1P49817 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cav1P49817 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Cav1P49817 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cav1P49817 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cav1P49817 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cav1P49817 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cav1P49817 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cav1P49817 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cav1P49817 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cav1P49817 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cav1P49817 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cav1P49817 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cav1P49817 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cav1P49817 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cav1P49817 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cav1P49817 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cav1P49817 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cav1P49817 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cav1P49817 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cav1P49817 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cav1P49817 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cav1P49817 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cav1P49817 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cav1P49817 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cav1P49817 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cav1P49817 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cav1P49817 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cav1P49817 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cav1P49817 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cav1P49817 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cav1P49817 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms