Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmod1P49813 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmod1P49813 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmod1P49813 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmod1P49813 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmod1P49813 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmod1P49813 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmod1P49813 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
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Tmod1P49813 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmod1P49813 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
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Tmod1P49813 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmod1P49813 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
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Tmod1P49813 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmod1P49813 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmod1P49813 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmod1P49813 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmod1P49813 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmod1P49813 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmod1P49813 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmod1P49813 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmod1P49813 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmod1P49813 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmod1P49813 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmod1P49813 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmod1P49813 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmod1P49813 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmod1P49813 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmod1P49813 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmod1P49813 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tmod1P49813 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tmod1P49813 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tmod1P49813 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tmod1P49813 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
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Tmod1P49813 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmod1P49813 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmod1P49813 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmod1P49813 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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Tmod1P49813 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmod1P49813 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmod1P49813 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmod1P49813 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmod1P49813 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmod1P49813 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmod1P49813 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmod1P49813 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmod1P49813 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmod1P49813 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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Tmod1P49813 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmod1P49813 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmod1P49813 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmod1P49813 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmod1P49813 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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Tmod1P49813 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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Tmod1P49813 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmod1P49813 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmod1P49813 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
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Tmod1P49813 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmod1P49813 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmod1P49813 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmod1P49813 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
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Tmod1P49813 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmod1P49813 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmod1P49813 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmod1P49813 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmod1P49813 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmod1P49813 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmod1P49813 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmod1P49813 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmod1P49813 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmod1P49813 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmod1P49813 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmod1P49813 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmod1P49813 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmod1P49813 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmod1P49813 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmod1P49813 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmod1P49813 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
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Tmod1P49813 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
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