Protein–RNA interactions for Protein: P49429

Hpd, 4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HpdP49429 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HpdP49429 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HpdP49429 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HpdP49429 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HpdP49429 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HpdP49429 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HpdP49429 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HpdP49429 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HpdP49429 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HpdP49429 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HpdP49429 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HpdP49429 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HpdP49429 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HpdP49429 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HpdP49429 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HpdP49429 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HpdP49429 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
HpdP49429 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HpdP49429 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HpdP49429 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
HpdP49429 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HpdP49429 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HpdP49429 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HpdP49429 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HpdP49429 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HpdP49429 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HpdP49429 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HpdP49429 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HpdP49429 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HpdP49429 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
HpdP49429 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HpdP49429 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
HpdP49429 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HpdP49429 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HpdP49429 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HpdP49429 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HpdP49429 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HpdP49429 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HpdP49429 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HpdP49429 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HpdP49429 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HpdP49429 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HpdP49429 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HpdP49429 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HpdP49429 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HpdP49429 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HpdP49429 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HpdP49429 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HpdP49429 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HpdP49429 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HpdP49429 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HpdP49429 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HpdP49429 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HpdP49429 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HpdP49429 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
HpdP49429 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HpdP49429 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HpdP49429 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HpdP49429 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HpdP49429 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HpdP49429 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HpdP49429 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HpdP49429 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HpdP49429 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HpdP49429 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HpdP49429 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HpdP49429 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HpdP49429 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HpdP49429 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HpdP49429 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HpdP49429 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HpdP49429 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HpdP49429 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HpdP49429 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HpdP49429 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HpdP49429 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HpdP49429 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HpdP49429 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HpdP49429 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HpdP49429 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HpdP49429 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
HpdP49429 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HpdP49429 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HpdP49429 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HpdP49429 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HpdP49429 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HpdP49429 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HpdP49429 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HpdP49429 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HpdP49429 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HpdP49429 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HpdP49429 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HpdP49429 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HpdP49429 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HpdP49429 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HpdP49429 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HpdP49429 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HpdP49429 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HpdP49429 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HpdP49429 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms