Protein–RNA interactions for Protein: P48787

Tnni3, Troponin I, cardiac muscle, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3P48787 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tnni3P48787 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tnni3P48787 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tnni3P48787 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Tnni3P48787 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tnni3P48787 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tnni3P48787 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tnni3P48787 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tnni3P48787 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Tnni3P48787 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tnni3P48787 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tnni3P48787 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tnni3P48787 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tnni3P48787 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tnni3P48787 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tnni3P48787 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tnni3P48787 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tnni3P48787 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tnni3P48787 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tnni3P48787 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tnni3P48787 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tnni3P48787 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tnni3P48787 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tnni3P48787 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tnni3P48787 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tnni3P48787 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tnni3P48787 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tnni3P48787 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tnni3P48787 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tnni3P48787 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tnni3P48787 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tnni3P48787 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tnni3P48787 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tnni3P48787 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tnni3P48787 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tnni3P48787 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tnni3P48787 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tnni3P48787 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Tnni3P48787 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tnni3P48787 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Tnni3P48787 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tnni3P48787 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tnni3P48787 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tnni3P48787 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Tnni3P48787 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tnni3P48787 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tnni3P48787 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tnni3P48787 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Tnni3P48787 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tnni3P48787 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tnni3P48787 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tnni3P48787 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tnni3P48787 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tnni3P48787 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Tnni3P48787 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tnni3P48787 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tnni3P48787 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tnni3P48787 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tnni3P48787 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tnni3P48787 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tnni3P48787 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tnni3P48787 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tnni3P48787 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tnni3P48787 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tnni3P48787 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tnni3P48787 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tnni3P48787 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tnni3P48787 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tnni3P48787 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tnni3P48787 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tnni3P48787 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tnni3P48787 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tnni3P48787 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tnni3P48787 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Tnni3P48787 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tnni3P48787 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tnni3P48787 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tnni3P48787 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tnni3P48787 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tnni3P48787 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tnni3P48787 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tnni3P48787 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tnni3P48787 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tnni3P48787 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tnni3P48787 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tnni3P48787 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tnni3P48787 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tnni3P48787 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tnni3P48787 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tnni3P48787 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tnni3P48787 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tnni3P48787 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tnni3P48787 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tnni3P48787 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tnni3P48787 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tnni3P48787 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tnni3P48787 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tnni3P48787 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tnni3P48787 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tnni3P48787 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms