Protein–RNA interactions for Protein: P48540

Gdnf, Glial cell line-derived neurotrophic factor, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GdnfP48540 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GdnfP48540 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GdnfP48540 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GdnfP48540 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GdnfP48540 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GdnfP48540 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GdnfP48540 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GdnfP48540 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GdnfP48540 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GdnfP48540 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GdnfP48540 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GdnfP48540 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GdnfP48540 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GdnfP48540 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GdnfP48540 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GdnfP48540 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GdnfP48540 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GdnfP48540 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GdnfP48540 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GdnfP48540 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GdnfP48540 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GdnfP48540 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GdnfP48540 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GdnfP48540 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GdnfP48540 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GdnfP48540 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GdnfP48540 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GdnfP48540 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
GdnfP48540 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GdnfP48540 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GdnfP48540 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GdnfP48540 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GdnfP48540 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GdnfP48540 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GdnfP48540 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GdnfP48540 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GdnfP48540 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GdnfP48540 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
GdnfP48540 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GdnfP48540 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GdnfP48540 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GdnfP48540 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GdnfP48540 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GdnfP48540 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GdnfP48540 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GdnfP48540 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GdnfP48540 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GdnfP48540 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GdnfP48540 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GdnfP48540 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GdnfP48540 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GdnfP48540 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GdnfP48540 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GdnfP48540 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GdnfP48540 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GdnfP48540 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GdnfP48540 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GdnfP48540 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GdnfP48540 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GdnfP48540 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GdnfP48540 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GdnfP48540 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GdnfP48540 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GdnfP48540 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GdnfP48540 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GdnfP48540 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GdnfP48540 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GdnfP48540 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GdnfP48540 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GdnfP48540 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GdnfP48540 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GdnfP48540 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GdnfP48540 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GdnfP48540 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GdnfP48540 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GdnfP48540 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GdnfP48540 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GdnfP48540 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GdnfP48540 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GdnfP48540 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GdnfP48540 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GdnfP48540 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GdnfP48540 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GdnfP48540 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GdnfP48540 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GdnfP48540 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GdnfP48540 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GdnfP48540 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GdnfP48540 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GdnfP48540 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GdnfP48540 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GdnfP48540 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GdnfP48540 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GdnfP48540 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GdnfP48540 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GdnfP48540 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GdnfP48540 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GdnfP48540 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GdnfP48540 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GdnfP48540 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms