Protein–RNA interactions for Protein: P48410

Abcd1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd1P48410 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Abcd1P48410 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Abcd1P48410 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Abcd1P48410 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Abcd1P48410 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Abcd1P48410 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Abcd1P48410 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Abcd1P48410 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Abcd1P48410 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Abcd1P48410 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Abcd1P48410 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Abcd1P48410 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Abcd1P48410 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Abcd1P48410 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Abcd1P48410 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Abcd1P48410 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Abcd1P48410 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Abcd1P48410 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Abcd1P48410 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Abcd1P48410 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Abcd1P48410 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Abcd1P48410 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Abcd1P48410 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Abcd1P48410 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Abcd1P48410 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Abcd1P48410 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Abcd1P48410 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Abcd1P48410 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Abcd1P48410 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Abcd1P48410 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Abcd1P48410 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Abcd1P48410 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Abcd1P48410 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Abcd1P48410 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Abcd1P48410 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Abcd1P48410 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Abcd1P48410 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Abcd1P48410 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Abcd1P48410 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Abcd1P48410 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Abcd1P48410 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Abcd1P48410 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Abcd1P48410 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Abcd1P48410 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Abcd1P48410 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Abcd1P48410 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Abcd1P48410 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Abcd1P48410 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Abcd1P48410 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Abcd1P48410 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Abcd1P48410 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Abcd1P48410 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Abcd1P48410 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Abcd1P48410 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Abcd1P48410 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Abcd1P48410 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Abcd1P48410 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Abcd1P48410 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Abcd1P48410 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Abcd1P48410 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Abcd1P48410 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Abcd1P48410 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Abcd1P48410 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Abcd1P48410 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Abcd1P48410 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Abcd1P48410 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Abcd1P48410 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Abcd1P48410 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Abcd1P48410 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Abcd1P48410 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Abcd1P48410 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Abcd1P48410 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Abcd1P48410 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Abcd1P48410 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Abcd1P48410 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Abcd1P48410 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Abcd1P48410 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Abcd1P48410 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Abcd1P48410 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Abcd1P48410 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Abcd1P48410 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Abcd1P48410 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Abcd1P48410 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Abcd1P48410 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Abcd1P48410 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Abcd1P48410 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Abcd1P48410 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Abcd1P48410 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Abcd1P48410 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Abcd1P48410 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Abcd1P48410 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Abcd1P48410 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Abcd1P48410 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Abcd1P48410 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Abcd1P48410 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Abcd1P48410 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Abcd1P48410 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Abcd1P48410 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Abcd1P48410 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Abcd1P48410 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms