Protein–RNA interactions for Protein: P47239

Pax7, Paired box protein Pax-7, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax7P47239 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pax7P47239 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Pax7P47239 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pax7P47239 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pax7P47239 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Pax7P47239 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pax7P47239 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Pax7P47239 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pax7P47239 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pax7P47239 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pax7P47239 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pax7P47239 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pax7P47239 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pax7P47239 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pax7P47239 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pax7P47239 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pax7P47239 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pax7P47239 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pax7P47239 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pax7P47239 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pax7P47239 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pax7P47239 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pax7P47239 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pax7P47239 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Pax7P47239 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Pax7P47239 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pax7P47239 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pax7P47239 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pax7P47239 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pax7P47239 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pax7P47239 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pax7P47239 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pax7P47239 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pax7P47239 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pax7P47239 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pax7P47239 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pax7P47239 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pax7P47239 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pax7P47239 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pax7P47239 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pax7P47239 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pax7P47239 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pax7P47239 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pax7P47239 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pax7P47239 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pax7P47239 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pax7P47239 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pax7P47239 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pax7P47239 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pax7P47239 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pax7P47239 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pax7P47239 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pax7P47239 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Pax7P47239 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pax7P47239 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pax7P47239 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pax7P47239 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pax7P47239 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pax7P47239 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pax7P47239 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pax7P47239 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pax7P47239 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pax7P47239 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pax7P47239 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pax7P47239 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pax7P47239 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pax7P47239 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pax7P47239 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pax7P47239 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pax7P47239 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pax7P47239 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pax7P47239 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pax7P47239 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pax7P47239 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pax7P47239 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pax7P47239 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pax7P47239 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pax7P47239 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pax7P47239 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pax7P47239 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pax7P47239 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pax7P47239 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pax7P47239 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pax7P47239 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pax7P47239 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Pax7P47239 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Pax7P47239 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pax7P47239 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pax7P47239 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pax7P47239 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pax7P47239 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pax7P47239 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pax7P47239 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pax7P47239 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pax7P47239 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pax7P47239 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pax7P47239 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pax7P47239 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pax7P47239 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pax7P47239 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.7 ms