Protein–RNA interactions for Protein: P46638

Rab11b, Ras-related protein Rab-11B, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11bP46638 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab11bP46638 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab11bP46638 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab11bP46638 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab11bP46638 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab11bP46638 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab11bP46638 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab11bP46638 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab11bP46638 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab11bP46638 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab11bP46638 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab11bP46638 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab11bP46638 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab11bP46638 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab11bP46638 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab11bP46638 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab11bP46638 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab11bP46638 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab11bP46638 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab11bP46638 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab11bP46638 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab11bP46638 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab11bP46638 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab11bP46638 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab11bP46638 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab11bP46638 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab11bP46638 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab11bP46638 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab11bP46638 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab11bP46638 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab11bP46638 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab11bP46638 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab11bP46638 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab11bP46638 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab11bP46638 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab11bP46638 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab11bP46638 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab11bP46638 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab11bP46638 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab11bP46638 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab11bP46638 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab11bP46638 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab11bP46638 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab11bP46638 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab11bP46638 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab11bP46638 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab11bP46638 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab11bP46638 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab11bP46638 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab11bP46638 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab11bP46638 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab11bP46638 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab11bP46638 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab11bP46638 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab11bP46638 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab11bP46638 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab11bP46638 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab11bP46638 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab11bP46638 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab11bP46638 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab11bP46638 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab11bP46638 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab11bP46638 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab11bP46638 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab11bP46638 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab11bP46638 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab11bP46638 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab11bP46638 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab11bP46638 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab11bP46638 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab11bP46638 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab11bP46638 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab11bP46638 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab11bP46638 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab11bP46638 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab11bP46638 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab11bP46638 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab11bP46638 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab11bP46638 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab11bP46638 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab11bP46638 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab11bP46638 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab11bP46638 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab11bP46638 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab11bP46638 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab11bP46638 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab11bP46638 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab11bP46638 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab11bP46638 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab11bP46638 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab11bP46638 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab11bP46638 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab11bP46638 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab11bP46638 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab11bP46638 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab11bP46638 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab11bP46638 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab11bP46638 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab11bP46638 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab11bP46638 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms