Protein–RNA interactions for Protein: P46099

Klf1, Krueppel-like factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf1P46099 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Klf1P46099 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Klf1P46099 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Klf1P46099 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Klf1P46099 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Klf1P46099 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Klf1P46099 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Klf1P46099 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Klf1P46099 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Klf1P46099 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Klf1P46099 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Klf1P46099 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Klf1P46099 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Klf1P46099 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Klf1P46099 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Klf1P46099 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Klf1P46099 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Klf1P46099 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Klf1P46099 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Klf1P46099 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Klf1P46099 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Klf1P46099 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Klf1P46099 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Klf1P46099 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Klf1P46099 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Klf1P46099 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Klf1P46099 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Klf1P46099 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Klf1P46099 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Klf1P46099 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Klf1P46099 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Klf1P46099 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Klf1P46099 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Klf1P46099 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Klf1P46099 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Klf1P46099 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Klf1P46099 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Klf1P46099 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Klf1P46099 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Klf1P46099 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Klf1P46099 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Klf1P46099 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Klf1P46099 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Klf1P46099 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Klf1P46099 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Klf1P46099 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Klf1P46099 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Klf1P46099 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Klf1P46099 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Klf1P46099 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Klf1P46099 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Klf1P46099 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Klf1P46099 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Klf1P46099 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Klf1P46099 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Klf1P46099 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Klf1P46099 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Klf1P46099 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Klf1P46099 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Klf1P46099 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Klf1P46099 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Klf1P46099 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Klf1P46099 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Klf1P46099 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Klf1P46099 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Klf1P46099 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Klf1P46099 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Klf1P46099 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Klf1P46099 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Klf1P46099 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Klf1P46099 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Klf1P46099 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Klf1P46099 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Klf1P46099 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Klf1P46099 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Klf1P46099 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Klf1P46099 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Klf1P46099 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Klf1P46099 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Klf1P46099 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Klf1P46099 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Klf1P46099 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Klf1P46099 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Klf1P46099 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Klf1P46099 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Klf1P46099 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Klf1P46099 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Klf1P46099 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Klf1P46099 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Klf1P46099 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Klf1P46099 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Klf1P46099 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Klf1P46099 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Klf1P46099 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Klf1P46099 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Klf1P46099 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Klf1P46099 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Klf1P46099 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Klf1P46099 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Klf1P46099 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms