Protein–RNA interactions for Protein: P43345

Tlx1, T-cell leukemia homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlx1P43345 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tlx1P43345 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tlx1P43345 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tlx1P43345 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tlx1P43345 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tlx1P43345 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tlx1P43345 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tlx1P43345 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Tlx1P43345 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tlx1P43345 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tlx1P43345 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tlx1P43345 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tlx1P43345 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tlx1P43345 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Tlx1P43345 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Tlx1P43345 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tlx1P43345 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tlx1P43345 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tlx1P43345 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tlx1P43345 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tlx1P43345 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tlx1P43345 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tlx1P43345 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Tlx1P43345 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Tlx1P43345 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Tlx1P43345 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tlx1P43345 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tlx1P43345 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tlx1P43345 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tlx1P43345 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tlx1P43345 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tlx1P43345 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tlx1P43345 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tlx1P43345 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tlx1P43345 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tlx1P43345 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tlx1P43345 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tlx1P43345 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tlx1P43345 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Tlx1P43345 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tlx1P43345 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tlx1P43345 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tlx1P43345 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Tlx1P43345 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tlx1P43345 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tlx1P43345 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tlx1P43345 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tlx1P43345 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tlx1P43345 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tlx1P43345 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tlx1P43345 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tlx1P43345 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tlx1P43345 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tlx1P43345 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tlx1P43345 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tlx1P43345 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tlx1P43345 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tlx1P43345 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tlx1P43345 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tlx1P43345 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tlx1P43345 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tlx1P43345 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tlx1P43345 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tlx1P43345 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tlx1P43345 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tlx1P43345 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tlx1P43345 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tlx1P43345 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tlx1P43345 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tlx1P43345 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tlx1P43345 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tlx1P43345 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tlx1P43345 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tlx1P43345 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tlx1P43345 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tlx1P43345 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tlx1P43345 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tlx1P43345 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tlx1P43345 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tlx1P43345 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tlx1P43345 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tlx1P43345 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tlx1P43345 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tlx1P43345 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tlx1P43345 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tlx1P43345 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tlx1P43345 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tlx1P43345 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tlx1P43345 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tlx1P43345 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tlx1P43345 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Tlx1P43345 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Tlx1P43345 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tlx1P43345 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tlx1P43345 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tlx1P43345 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tlx1P43345 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tlx1P43345 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tlx1P43345 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tlx1P43345 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms