Protein–RNA interactions for Protein: P43252

Ptgir, Prostacyclin receptor, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgirP43252 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PtgirP43252 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PtgirP43252 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PtgirP43252 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PtgirP43252 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PtgirP43252 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PtgirP43252 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PtgirP43252 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PtgirP43252 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PtgirP43252 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PtgirP43252 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PtgirP43252 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PtgirP43252 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PtgirP43252 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PtgirP43252 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PtgirP43252 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PtgirP43252 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PtgirP43252 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PtgirP43252 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PtgirP43252 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PtgirP43252 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PtgirP43252 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PtgirP43252 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PtgirP43252 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PtgirP43252 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PtgirP43252 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PtgirP43252 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PtgirP43252 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PtgirP43252 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PtgirP43252 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtgirP43252 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtgirP43252 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PtgirP43252 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtgirP43252 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtgirP43252 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtgirP43252 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtgirP43252 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtgirP43252 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtgirP43252 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtgirP43252 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtgirP43252 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtgirP43252 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtgirP43252 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtgirP43252 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtgirP43252 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtgirP43252 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtgirP43252 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtgirP43252 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtgirP43252 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtgirP43252 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtgirP43252 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtgirP43252 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtgirP43252 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PtgirP43252 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PtgirP43252 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PtgirP43252 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PtgirP43252 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PtgirP43252 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PtgirP43252 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PtgirP43252 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PtgirP43252 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PtgirP43252 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PtgirP43252 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PtgirP43252 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PtgirP43252 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PtgirP43252 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PtgirP43252 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PtgirP43252 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PtgirP43252 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PtgirP43252 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PtgirP43252 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PtgirP43252 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PtgirP43252 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PtgirP43252 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PtgirP43252 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PtgirP43252 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PtgirP43252 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PtgirP43252 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PtgirP43252 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PtgirP43252 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PtgirP43252 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PtgirP43252 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PtgirP43252 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PtgirP43252 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PtgirP43252 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PtgirP43252 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PtgirP43252 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PtgirP43252 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PtgirP43252 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PtgirP43252 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PtgirP43252 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PtgirP43252 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PtgirP43252 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PtgirP43252 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PtgirP43252 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PtgirP43252 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PtgirP43252 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PtgirP43252 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PtgirP43252 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PtgirP43252 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms