Protein–RNA interactions for Protein: P43024

Cox6a1, Cytochrome c oxidase subunit 6A1, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox6a1P43024 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cox6a1P43024 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cox6a1P43024 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cox6a1P43024 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cox6a1P43024 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cox6a1P43024 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cox6a1P43024 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cox6a1P43024 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cox6a1P43024 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cox6a1P43024 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cox6a1P43024 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cox6a1P43024 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cox6a1P43024 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cox6a1P43024 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cox6a1P43024 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cox6a1P43024 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cox6a1P43024 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cox6a1P43024 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cox6a1P43024 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cox6a1P43024 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cox6a1P43024 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cox6a1P43024 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cox6a1P43024 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cox6a1P43024 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cox6a1P43024 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cox6a1P43024 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cox6a1P43024 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cox6a1P43024 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cox6a1P43024 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cox6a1P43024 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cox6a1P43024 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cox6a1P43024 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cox6a1P43024 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cox6a1P43024 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cox6a1P43024 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cox6a1P43024 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cox6a1P43024 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cox6a1P43024 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cox6a1P43024 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cox6a1P43024 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cox6a1P43024 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cox6a1P43024 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cox6a1P43024 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cox6a1P43024 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cox6a1P43024 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cox6a1P43024 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cox6a1P43024 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cox6a1P43024 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cox6a1P43024 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cox6a1P43024 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cox6a1P43024 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cox6a1P43024 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cox6a1P43024 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cox6a1P43024 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cox6a1P43024 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cox6a1P43024 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cox6a1P43024 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cox6a1P43024 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cox6a1P43024 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cox6a1P43024 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cox6a1P43024 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cox6a1P43024 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cox6a1P43024 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cox6a1P43024 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cox6a1P43024 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cox6a1P43024 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cox6a1P43024 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cox6a1P43024 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cox6a1P43024 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cox6a1P43024 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cox6a1P43024 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cox6a1P43024 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cox6a1P43024 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cox6a1P43024 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cox6a1P43024 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cox6a1P43024 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cox6a1P43024 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cox6a1P43024 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cox6a1P43024 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cox6a1P43024 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cox6a1P43024 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cox6a1P43024 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cox6a1P43024 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cox6a1P43024 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cox6a1P43024 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cox6a1P43024 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cox6a1P43024 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cox6a1P43024 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cox6a1P43024 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cox6a1P43024 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cox6a1P43024 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cox6a1P43024 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cox6a1P43024 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cox6a1P43024 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cox6a1P43024 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cox6a1P43024 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cox6a1P43024 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cox6a1P43024 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cox6a1P43024 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cox6a1P43024 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms