Protein–RNA interactions for Protein: P41245

Mmp9, Matrix metalloproteinase-9, mousemouse

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Length 730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp9P41245 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mmp9P41245 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mmp9P41245 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Mmp9P41245 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mmp9P41245 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mmp9P41245 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Mmp9P41245 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mmp9P41245 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mmp9P41245 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mmp9P41245 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mmp9P41245 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mmp9P41245 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mmp9P41245 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mmp9P41245 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mmp9P41245 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mmp9P41245 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mmp9P41245 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mmp9P41245 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mmp9P41245 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mmp9P41245 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mmp9P41245 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mmp9P41245 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mmp9P41245 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mmp9P41245 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mmp9P41245 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mmp9P41245 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mmp9P41245 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Mmp9P41245 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mmp9P41245 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mmp9P41245 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mmp9P41245 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mmp9P41245 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mmp9P41245 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mmp9P41245 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mmp9P41245 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mmp9P41245 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mmp9P41245 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mmp9P41245 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Mmp9P41245 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mmp9P41245 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mmp9P41245 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mmp9P41245 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Mmp9P41245 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mmp9P41245 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mmp9P41245 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mmp9P41245 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mmp9P41245 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Mmp9P41245 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Mmp9P41245 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mmp9P41245 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mmp9P41245 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mmp9P41245 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mmp9P41245 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mmp9P41245 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mmp9P41245 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mmp9P41245 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mmp9P41245 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Mmp9P41245 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mmp9P41245 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mmp9P41245 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mmp9P41245 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mmp9P41245 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp9P41245 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp9P41245 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp9P41245 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp9P41245 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp9P41245 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp9P41245 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp9P41245 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp9P41245 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp9P41245 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp9P41245 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp9P41245 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp9P41245 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp9P41245 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp9P41245 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp9P41245 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp9P41245 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp9P41245 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp9P41245 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp9P41245 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp9P41245 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp9P41245 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp9P41245 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp9P41245 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp9P41245 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp9P41245 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp9P41245 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp9P41245 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp9P41245 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp9P41245 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp9P41245 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp9P41245 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp9P41245 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp9P41245 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp9P41245 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp9P41245 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp9P41245 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp9P41245 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mmp9P41245 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
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