Protein–RNA interactions for Protein: P41164

Etv1, ETS translocation variant 1, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Etv1P41164 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Etv1P41164 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Etv1P41164 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Etv1P41164 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Etv1P41164 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Etv1P41164 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Etv1P41164 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Etv1P41164 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Etv1P41164 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Etv1P41164 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Etv1P41164 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Etv1P41164 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Etv1P41164 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Etv1P41164 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Etv1P41164 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Etv1P41164 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Etv1P41164 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Etv1P41164 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Etv1P41164 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Etv1P41164 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Etv1P41164 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Etv1P41164 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Etv1P41164 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Etv1P41164 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Etv1P41164 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Etv1P41164 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Etv1P41164 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Etv1P41164 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Etv1P41164 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Etv1P41164 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Etv1P41164 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Etv1P41164 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Etv1P41164 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Etv1P41164 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Etv1P41164 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Etv1P41164 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Etv1P41164 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Etv1P41164 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Etv1P41164 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Etv1P41164 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Etv1P41164 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Etv1P41164 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Etv1P41164 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Etv1P41164 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Etv1P41164 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Etv1P41164 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Etv1P41164 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Etv1P41164 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Etv1P41164 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Etv1P41164 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Etv1P41164 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Etv1P41164 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Etv1P41164 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Etv1P41164 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Etv1P41164 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Etv1P41164 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Etv1P41164 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Etv1P41164 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Etv1P41164 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Etv1P41164 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Etv1P41164 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Etv1P41164 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Etv1P41164 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Etv1P41164 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Etv1P41164 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Etv1P41164 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Etv1P41164 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Etv1P41164 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Etv1P41164 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Etv1P41164 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Etv1P41164 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Etv1P41164 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Etv1P41164 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Etv1P41164 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Etv1P41164 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Etv1P41164 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Etv1P41164 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Etv1P41164 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Etv1P41164 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Etv1P41164 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Etv1P41164 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Etv1P41164 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Etv1P41164 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Etv1P41164 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Etv1P41164 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Etv1P41164 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Etv1P41164 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Etv1P41164 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Etv1P41164 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Etv1P41164 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Etv1P41164 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Etv1P41164 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Etv1P41164 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Etv1P41164 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Etv1P41164 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Etv1P41164 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Etv1P41164 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Etv1P41164 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Etv1P41164 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Etv1P41164 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms