Protein–RNA interactions for Protein: P40226

Thpo, Thrombopoietin, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ThpoP40226 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ThpoP40226 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ThpoP40226 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ThpoP40226 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ThpoP40226 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ThpoP40226 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ThpoP40226 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ThpoP40226 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ThpoP40226 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ThpoP40226 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ThpoP40226 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ThpoP40226 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ThpoP40226 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ThpoP40226 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ThpoP40226 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ThpoP40226 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ThpoP40226 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ThpoP40226 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ThpoP40226 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ThpoP40226 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ThpoP40226 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ThpoP40226 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ThpoP40226 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ThpoP40226 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ThpoP40226 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ThpoP40226 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ThpoP40226 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ThpoP40226 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ThpoP40226 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ThpoP40226 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ThpoP40226 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ThpoP40226 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ThpoP40226 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ThpoP40226 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ThpoP40226 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ThpoP40226 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ThpoP40226 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ThpoP40226 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ThpoP40226 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ThpoP40226 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ThpoP40226 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ThpoP40226 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ThpoP40226 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ThpoP40226 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ThpoP40226 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ThpoP40226 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ThpoP40226 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ThpoP40226 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ThpoP40226 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ThpoP40226 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ThpoP40226 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ThpoP40226 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ThpoP40226 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ThpoP40226 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ThpoP40226 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ThpoP40226 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ThpoP40226 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ThpoP40226 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ThpoP40226 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ThpoP40226 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ThpoP40226 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ThpoP40226 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ThpoP40226 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ThpoP40226 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ThpoP40226 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ThpoP40226 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ThpoP40226 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ThpoP40226 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ThpoP40226 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ThpoP40226 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ThpoP40226 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ThpoP40226 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ThpoP40226 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ThpoP40226 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ThpoP40226 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ThpoP40226 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ThpoP40226 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ThpoP40226 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ThpoP40226 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ThpoP40226 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ThpoP40226 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ThpoP40226 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ThpoP40226 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ThpoP40226 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ThpoP40226 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ThpoP40226 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ThpoP40226 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ThpoP40226 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ThpoP40226 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ThpoP40226 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ThpoP40226 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ThpoP40226 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ThpoP40226 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ThpoP40226 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ThpoP40226 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ThpoP40226 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ThpoP40226 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ThpoP40226 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ThpoP40226 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ThpoP40226 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms