Protein–RNA interactions for Protein: P40223

Csf3r, Granulocyte colony-stimulating factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf3rP40223 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Csf3rP40223 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Csf3rP40223 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Csf3rP40223 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Csf3rP40223 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Csf3rP40223 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Csf3rP40223 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Csf3rP40223 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Csf3rP40223 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Csf3rP40223 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Csf3rP40223 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Csf3rP40223 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
Csf3rP40223 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Csf3rP40223 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Csf3rP40223 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Csf3rP40223 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Csf3rP40223 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Csf3rP40223 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Csf3rP40223 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Csf3rP40223 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Csf3rP40223 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Csf3rP40223 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Csf3rP40223 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Csf3rP40223 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Csf3rP40223 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Csf3rP40223 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Csf3rP40223 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Csf3rP40223 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Csf3rP40223 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Csf3rP40223 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Csf3rP40223 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Csf3rP40223 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Csf3rP40223 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Csf3rP40223 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Csf3rP40223 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Csf3rP40223 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Csf3rP40223 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Csf3rP40223 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Csf3rP40223 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Csf3rP40223 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Csf3rP40223 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Csf3rP40223 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Csf3rP40223 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Csf3rP40223 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Csf3rP40223 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Csf3rP40223 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Csf3rP40223 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Csf3rP40223 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Csf3rP40223 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Csf3rP40223 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Csf3rP40223 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Csf3rP40223 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Csf3rP40223 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Csf3rP40223 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Csf3rP40223 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Csf3rP40223 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Csf3rP40223 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Csf3rP40223 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Csf3rP40223 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Csf3rP40223 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Csf3rP40223 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Csf3rP40223 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Csf3rP40223 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Csf3rP40223 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Csf3rP40223 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Csf3rP40223 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Csf3rP40223 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Csf3rP40223 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Csf3rP40223 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Csf3rP40223 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Csf3rP40223 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Csf3rP40223 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Csf3rP40223 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Csf3rP40223 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Csf3rP40223 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Csf3rP40223 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Csf3rP40223 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Csf3rP40223 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Csf3rP40223 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Csf3rP40223 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Csf3rP40223 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Csf3rP40223 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Csf3rP40223 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Csf3rP40223 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Csf3rP40223 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Csf3rP40223 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Csf3rP40223 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Csf3rP40223 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Csf3rP40223 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Csf3rP40223 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Csf3rP40223 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Csf3rP40223 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Csf3rP40223 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Csf3rP40223 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Csf3rP40223 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Csf3rP40223 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Csf3rP40223 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Csf3rP40223 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Csf3rP40223 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Csf3rP40223 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms