Protein–RNA interactions for Protein: P39428

Traf1, TNF receptor-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf1P39428 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Traf1P39428 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Traf1P39428 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Traf1P39428 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Traf1P39428 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Traf1P39428 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Traf1P39428 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Traf1P39428 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Traf1P39428 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Traf1P39428 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Traf1P39428 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Traf1P39428 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Traf1P39428 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Traf1P39428 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Traf1P39428 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Traf1P39428 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Traf1P39428 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Traf1P39428 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Traf1P39428 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Traf1P39428 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Traf1P39428 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Traf1P39428 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Traf1P39428 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Traf1P39428 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Traf1P39428 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Traf1P39428 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Traf1P39428 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Traf1P39428 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Traf1P39428 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Traf1P39428 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Traf1P39428 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Traf1P39428 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Traf1P39428 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Traf1P39428 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Traf1P39428 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Traf1P39428 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Traf1P39428 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Traf1P39428 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Traf1P39428 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Traf1P39428 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Traf1P39428 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Traf1P39428 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Traf1P39428 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Traf1P39428 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Traf1P39428 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Traf1P39428 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Traf1P39428 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Traf1P39428 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Traf1P39428 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Traf1P39428 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Traf1P39428 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Traf1P39428 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Traf1P39428 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Traf1P39428 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Traf1P39428 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Traf1P39428 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Traf1P39428 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Traf1P39428 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Traf1P39428 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Traf1P39428 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Traf1P39428 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Traf1P39428 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Traf1P39428 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
Traf1P39428 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Traf1P39428 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Traf1P39428 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Traf1P39428 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Traf1P39428 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Traf1P39428 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Traf1P39428 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Traf1P39428 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Traf1P39428 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Traf1P39428 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Traf1P39428 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Traf1P39428 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Traf1P39428 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Traf1P39428 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Traf1P39428 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Traf1P39428 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Traf1P39428 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Traf1P39428 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Traf1P39428 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Traf1P39428 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Traf1P39428 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Traf1P39428 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Traf1P39428 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Traf1P39428 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Traf1P39428 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Traf1P39428 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Traf1P39428 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Traf1P39428 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Traf1P39428 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Traf1P39428 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Traf1P39428 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Traf1P39428 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Traf1P39428 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Traf1P39428 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Traf1P39428 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Traf1P39428 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Traf1P39428 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms