Protein–RNA interactions for Protein: P39087

Grik2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik2P39087 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Grik2P39087 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Grik2P39087 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Grik2P39087 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Grik2P39087 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Grik2P39087 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Grik2P39087 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Grik2P39087 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Grik2P39087 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Grik2P39087 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Grik2P39087 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Grik2P39087 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Grik2P39087 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Grik2P39087 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Grik2P39087 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Grik2P39087 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Grik2P39087 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Grik2P39087 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Grik2P39087 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Grik2P39087 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Grik2P39087 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Grik2P39087 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Grik2P39087 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Grik2P39087 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Grik2P39087 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Grik2P39087 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Grik2P39087 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Grik2P39087 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Grik2P39087 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Grik2P39087 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Grik2P39087 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Grik2P39087 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Grik2P39087 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Grik2P39087 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Grik2P39087 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Grik2P39087 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Grik2P39087 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Grik2P39087 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Grik2P39087 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Grik2P39087 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Grik2P39087 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Grik2P39087 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Grik2P39087 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Grik2P39087 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Grik2P39087 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Grik2P39087 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Grik2P39087 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Grik2P39087 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Grik2P39087 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Grik2P39087 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Grik2P39087 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Grik2P39087 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Grik2P39087 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Grik2P39087 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Grik2P39087 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Grik2P39087 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Grik2P39087 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Grik2P39087 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Grik2P39087 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Grik2P39087 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Grik2P39087 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Grik2P39087 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Grik2P39087 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Grik2P39087 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Grik2P39087 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Grik2P39087 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Grik2P39087 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Grik2P39087 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Grik2P39087 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Grik2P39087 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Grik2P39087 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Grik2P39087 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Grik2P39087 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Grik2P39087 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Grik2P39087 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Grik2P39087 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Grik2P39087 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Grik2P39087 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Grik2P39087 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Grik2P39087 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Grik2P39087 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Grik2P39087 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Grik2P39087 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Grik2P39087 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Grik2P39087 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Grik2P39087 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Grik2P39087 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Grik2P39087 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Grik2P39087 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Grik2P39087 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Grik2P39087 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Grik2P39087 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Grik2P39087 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Grik2P39087 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Grik2P39087 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Grik2P39087 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Grik2P39087 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Grik2P39087 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Grik2P39087 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Grik2P39087 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms