Protein–RNA interactions for Protein: P38575

Upk2, Uroplakin-2, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk2P38575 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Upk2P38575 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Upk2P38575 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Upk2P38575 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Upk2P38575 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Upk2P38575 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Upk2P38575 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Upk2P38575 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Upk2P38575 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Upk2P38575 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Upk2P38575 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Upk2P38575 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Upk2P38575 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Upk2P38575 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Upk2P38575 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Upk2P38575 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Upk2P38575 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Upk2P38575 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Upk2P38575 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Upk2P38575 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Upk2P38575 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Upk2P38575 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Upk2P38575 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Upk2P38575 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Upk2P38575 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Upk2P38575 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Upk2P38575 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Upk2P38575 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Upk2P38575 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Upk2P38575 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Upk2P38575 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Upk2P38575 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Upk2P38575 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Upk2P38575 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Upk2P38575 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Upk2P38575 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Upk2P38575 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Upk2P38575 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Upk2P38575 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Upk2P38575 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Upk2P38575 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Upk2P38575 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Upk2P38575 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Upk2P38575 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Upk2P38575 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Upk2P38575 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Upk2P38575 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Upk2P38575 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Upk2P38575 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Upk2P38575 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Upk2P38575 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Upk2P38575 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Upk2P38575 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Upk2P38575 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Upk2P38575 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Upk2P38575 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Upk2P38575 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Upk2P38575 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Upk2P38575 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Upk2P38575 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Upk2P38575 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Upk2P38575 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Upk2P38575 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Upk2P38575 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Upk2P38575 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Upk2P38575 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Upk2P38575 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Upk2P38575 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Upk2P38575 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Upk2P38575 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Upk2P38575 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Upk2P38575 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Upk2P38575 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Upk2P38575 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Upk2P38575 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Upk2P38575 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Upk2P38575 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Upk2P38575 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Upk2P38575 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Upk2P38575 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Upk2P38575 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Upk2P38575 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Upk2P38575 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Upk2P38575 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Upk2P38575 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Upk2P38575 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Upk2P38575 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Upk2P38575 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Upk2P38575 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Upk2P38575 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Upk2P38575 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Upk2P38575 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Upk2P38575 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Upk2P38575 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Upk2P38575 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Upk2P38575 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Upk2P38575 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Upk2P38575 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Upk2P38575 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Upk2P38575 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms