Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Lig1P37913 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Lig1P37913 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Lig1P37913 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Lig1P37913 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Lig1P37913 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Lig1P37913 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Lig1P37913 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Lig1P37913 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Lig1P37913 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Lig1P37913 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Lig1P37913 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Lig1P37913 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Lig1P37913 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Lig1P37913 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Lig1P37913 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Lig1P37913 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Lig1P37913 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Lig1P37913 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Lig1P37913 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Lig1P37913 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Lig1P37913 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Lig1P37913 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Lig1P37913 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Lig1P37913 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Lig1P37913 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Lig1P37913 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Lig1P37913 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Lig1P37913 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Lig1P37913 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Lig1P37913 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Lig1P37913 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Lig1P37913 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Lig1P37913 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Lig1P37913 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Lig1P37913 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Lig1P37913 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Lig1P37913 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Lig1P37913 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Lig1P37913 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Lig1P37913 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Lig1P37913 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Lig1P37913 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Lig1P37913 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Lig1P37913 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Lig1P37913 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Lig1P37913 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Lig1P37913 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Lig1P37913 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Lig1P37913 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Lig1P37913 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Lig1P37913 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Lig1P37913 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Lig1P37913 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Lig1P37913 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Lig1P37913 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Lig1P37913 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Lig1P37913 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Lig1P37913 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Lig1P37913 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Lig1P37913 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Lig1P37913 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Lig1P37913 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Lig1P37913 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Lig1P37913 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Lig1P37913 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Lig1P37913 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Lig1P37913 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Lig1P37913 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Lig1P37913 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Lig1P37913 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Lig1P37913 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Lig1P37913 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Lig1P37913 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Lig1P37913 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Lig1P37913 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Lig1P37913 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Lig1P37913 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Lig1P37913 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Lig1P37913 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Lig1P37913 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Lig1P37913 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Lig1P37913 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Lig1P37913 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Lig1P37913 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Lig1P37913 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Lig1P37913 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Lig1P37913 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Lig1P37913 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Lig1P37913 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Lig1P37913 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Lig1P37913 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Lig1P37913 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Lig1P37913 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Lig1P37913 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Lig1P37913 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Lig1P37913 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Lig1P37913 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Lig1P37913 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Lig1P37913 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms