Protein–RNA interactions for Protein: P36536

Sar1a, GTP-binding protein SAR1a, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sar1aP36536 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sar1aP36536 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sar1aP36536 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sar1aP36536 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sar1aP36536 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Sar1aP36536 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sar1aP36536 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sar1aP36536 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sar1aP36536 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sar1aP36536 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sar1aP36536 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sar1aP36536 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sar1aP36536 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Sar1aP36536 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sar1aP36536 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sar1aP36536 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sar1aP36536 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sar1aP36536 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sar1aP36536 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sar1aP36536 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sar1aP36536 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sar1aP36536 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sar1aP36536 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sar1aP36536 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sar1aP36536 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sar1aP36536 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sar1aP36536 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sar1aP36536 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sar1aP36536 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sar1aP36536 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sar1aP36536 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sar1aP36536 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sar1aP36536 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sar1aP36536 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sar1aP36536 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sar1aP36536 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sar1aP36536 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sar1aP36536 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sar1aP36536 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sar1aP36536 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sar1aP36536 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sar1aP36536 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sar1aP36536 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sar1aP36536 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Sar1aP36536 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sar1aP36536 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sar1aP36536 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sar1aP36536 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Sar1aP36536 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sar1aP36536 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sar1aP36536 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Sar1aP36536 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sar1aP36536 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sar1aP36536 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sar1aP36536 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sar1aP36536 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sar1aP36536 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sar1aP36536 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Sar1aP36536 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sar1aP36536 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sar1aP36536 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Sar1aP36536 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sar1aP36536 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sar1aP36536 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sar1aP36536 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sar1aP36536 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sar1aP36536 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Sar1aP36536 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Sar1aP36536 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sar1aP36536 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sar1aP36536 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sar1aP36536 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sar1aP36536 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sar1aP36536 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sar1aP36536 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sar1aP36536 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sar1aP36536 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sar1aP36536 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sar1aP36536 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sar1aP36536 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sar1aP36536 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sar1aP36536 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sar1aP36536 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sar1aP36536 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sar1aP36536 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Sar1aP36536 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sar1aP36536 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sar1aP36536 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sar1aP36536 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sar1aP36536 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sar1aP36536 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sar1aP36536 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sar1aP36536 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sar1aP36536 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sar1aP36536 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sar1aP36536 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sar1aP36536 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sar1aP36536 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sar1aP36536 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sar1aP36536 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms