Protein–RNA interactions for Protein: P35175

Stfa1, Stefin-1, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stfa1P35175 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Stfa1P35175 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stfa1P35175 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stfa1P35175 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stfa1P35175 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stfa1P35175 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stfa1P35175 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stfa1P35175 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stfa1P35175 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stfa1P35175 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stfa1P35175 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stfa1P35175 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stfa1P35175 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stfa1P35175 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stfa1P35175 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stfa1P35175 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stfa1P35175 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stfa1P35175 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stfa1P35175 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stfa1P35175 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stfa1P35175 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stfa1P35175 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Stfa1P35175 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Stfa1P35175 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stfa1P35175 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stfa1P35175 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stfa1P35175 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stfa1P35175 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stfa1P35175 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stfa1P35175 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stfa1P35175 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stfa1P35175 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stfa1P35175 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stfa1P35175 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stfa1P35175 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stfa1P35175 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stfa1P35175 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stfa1P35175 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stfa1P35175 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stfa1P35175 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stfa1P35175 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stfa1P35175 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Stfa1P35175 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stfa1P35175 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stfa1P35175 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stfa1P35175 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stfa1P35175 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stfa1P35175 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stfa1P35175 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stfa1P35175 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stfa1P35175 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stfa1P35175 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stfa1P35175 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stfa1P35175 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stfa1P35175 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stfa1P35175 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stfa1P35175 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stfa1P35175 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stfa1P35175 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stfa1P35175 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stfa1P35175 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stfa1P35175 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stfa1P35175 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stfa1P35175 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stfa1P35175 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stfa1P35175 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stfa1P35175 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Stfa1P35175 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stfa1P35175 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stfa1P35175 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stfa1P35175 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stfa1P35175 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stfa1P35175 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stfa1P35175 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stfa1P35175 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stfa1P35175 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stfa1P35175 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stfa1P35175 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stfa1P35175 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stfa1P35175 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stfa1P35175 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stfa1P35175 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stfa1P35175 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stfa1P35175 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stfa1P35175 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stfa1P35175 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stfa1P35175 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stfa1P35175 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stfa1P35175 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stfa1P35175 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stfa1P35175 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stfa1P35175 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stfa1P35175 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stfa1P35175 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stfa1P35175 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stfa1P35175 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stfa1P35175 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Stfa1P35175 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Stfa1P35175 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stfa1P35175 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms