Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nedd1P33215 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nedd1P33215 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Nedd1P33215 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nedd1P33215 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nedd1P33215 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nedd1P33215 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nedd1P33215 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nedd1P33215 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nedd1P33215 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nedd1P33215 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nedd1P33215 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nedd1P33215 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nedd1P33215 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nedd1P33215 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nedd1P33215 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nedd1P33215 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nedd1P33215 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nedd1P33215 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nedd1P33215 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nedd1P33215 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nedd1P33215 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nedd1P33215 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nedd1P33215 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nedd1P33215 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nedd1P33215 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nedd1P33215 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nedd1P33215 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nedd1P33215 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Nedd1P33215 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nedd1P33215 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nedd1P33215 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Nedd1P33215 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nedd1P33215 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nedd1P33215 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nedd1P33215 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nedd1P33215 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nedd1P33215 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nedd1P33215 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nedd1P33215 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nedd1P33215 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Nedd1P33215 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nedd1P33215 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nedd1P33215 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nedd1P33215 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nedd1P33215 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nedd1P33215 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nedd1P33215 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nedd1P33215 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nedd1P33215 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Nedd1P33215 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nedd1P33215 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nedd1P33215 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nedd1P33215 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nedd1P33215 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Nedd1P33215 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nedd1P33215 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nedd1P33215 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nedd1P33215 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nedd1P33215 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nedd1P33215 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nedd1P33215 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nedd1P33215 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nedd1P33215 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Nedd1P33215 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nedd1P33215 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nedd1P33215 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nedd1P33215 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nedd1P33215 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nedd1P33215 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nedd1P33215 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Nedd1P33215 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Nedd1P33215 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nedd1P33215 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nedd1P33215 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nedd1P33215 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nedd1P33215 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nedd1P33215 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nedd1P33215 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nedd1P33215 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nedd1P33215 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nedd1P33215 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nedd1P33215 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nedd1P33215 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nedd1P33215 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nedd1P33215 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nedd1P33215 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Nedd1P33215 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nedd1P33215 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nedd1P33215 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nedd1P33215 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nedd1P33215 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nedd1P33215 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nedd1P33215 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nedd1P33215 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nedd1P33215 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nedd1P33215 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Nedd1P33215 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nedd1P33215 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nedd1P33215 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms